计算化学公社

标题: 求助：swiss-model建模，两端缺少残基如何补齐？ [打印本页]

作者
Author: tanyingjia 时间: 2021-11-9 13:03
标题: 求助：swiss-model建模，两端缺少残基如何补齐？
我在swiss-model同源建模，然后发现开始和最后各缺失100多残基。然而需要缺失残基的部分。如何通过其他方法补齐残基 (, 下载次数 Times of downloads: 33)

作者
Author: k64_cc 时间: 2021-11-9 13:25
开始和结束的部分不一定能构成有意义的二级结构，你看看PDB给的蛋白质结构，要是缺失的部分不影响整体结构就当没看见得了。

作者
Author: tanyingjia 时间: 2021-11-9 13:57
嗯嗯，因为我确实需要末端770多-800号残基，对接小分子

作者
Author: rpestana94 时间: 2021-11-9 21:52
you can get it by homology modeling, you can get the same structure you get from the modeling as template and get a new structure, using modeller or swiss-model to model that parts and bind together

作者
Author: tanyingjia 时间: 2021-11-10 12:39
Okay, I probably understand what you mean, I'll try it。Thanks！

作者
Author: boychuan 时间: 2021-11-23 11:05

tanyingjia 发表于 2021-11-10 12:39
Okay, I probably understand what you mean, I'll try it。Thanks！

how to try ,can you explain in detail ？

作者
Author: wendao 时间: 2021-11-30 14:39
alphafold2

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