计算化学公社

标题: 求助，gfortran编译器 [打印本页]

作者
Author: 进击的zhq 时间: 2021-11-15 10:48
标题: 求助，gfortran编译器
之前有看到orca此类错误 (, 下载次数 Times of downloads: 76) ，需要配gfortran编译器， (, 下载次数 Times of downloads: 74) 后面我查了，这个账号下是有这个编译器，不知道为什么还是报同样的错误，小白救助！！！

作者
Author: abin 时间: 2021-11-15 13:51
如果你确认你的输入文件没有问题,
可以试试如下的版本.

链接: https://pan.baidu.com/s/113XqRATBvIcmMv9JJAOCag 提取码: 9ttm

## Installation
yum/dnf -y install singularity
mkdir $HOME/bin
cp orca.v5.0.1-openmpi-v4.1.1-hpc4you.SIF $HOME/bin
mv $HOME/bin/orca.v5.0.1-openmpi-v4.1.1-hpc4you.SIF $HOME/bin/orca5

## Run calculations.
orca5 Your-Input-File > Your-Output-File &

No need to install any MPI on your server.

作者
Author: 进击的zhq 时间: 2021-11-15 17:14

abin 发表于 2021-11-15 13:51
如果你确认你的输入文件没有问题,
可以试试如下的版本.

你好，假如我已经有mpi会冲突吗？

作者
Author: abin 时间: 2021-11-15 18:17
本帖最后由 abin 于 2021-11-15 23:17 编辑

进击的zhq 发表于 2021-11-15 17:14
你好，假如我已经有mpi会冲突吗？

应该没有关系。

你自己试试呗。

我没有你的测试环境，没法测试。
补充一下,
我自己用的集群上, 有多种MPI, 多种版本ORCA.

上文提到的ORCA方案, 测试可用, centOS7 centOS8 centOS Stream均可用.
不支持centOS6.
理论上, 能安装singularity 3.6以上版本的Linux系统, 均可以使用.

作者
Author: sobereva 时间: 2021-11-15 23:32
你先确保串行计算能运行成功。
如果只有并行不行，换其它任务，看是否也都不成功。都不成功就是MPI库的问题，重新编译OpenMPI再试，并且确保当前激活的MPI库（mpirun命令对应的）就是这个OpenMPI。本来这个跟gfortran有没有就没有任何必然的关系。

作者
Author: 进击的zhq 时间: 2021-11-16 18:12
本帖最后由进击的zhq 于 2021-11-16 19:07 编辑

我一开始用的是orca501配套的是mpi4.1.1，就是串行可以，并行不行，后面我又重新卸了，换了orca421配mpi314，还是出现相同的错误，我把环境变量 (, 下载次数 Times of downloads: 76) 都设置了，
orca路径
(, 下载次数 Times of downloads: 72) ，
输入脚本 (, 下载次数 Times of downloads: 81)
网上扒的，还是报上面的那个错误
(, 下载次数 Times of downloads: 76) ，求助！！！

作者
Author: doublehs 时间: 2022-6-26 09:49

进击的zhq 发表于 2021-11-16 18:12
我一开始用的是orca501配套的是mpi4.1.1，就是串行可以，并行不行，后面我又重新卸了，换了orca421配mpi314 ...

我的也出现这样的问题，请问最后是怎么解决的呢？谢谢

作者
Author: bluewhale 时间: 2022-6-26 10:47
openmpi 4.1.1是如何安装的？

作者
Author: abin 时间: 2022-6-26 12:21

bluewhale 发表于 2022-6-26 10:47
openmpi 4.1.1是如何安装的？

试试这个方案.

http://bbs.keinsci.com/thread-26418-1-1.html

作者
Author: snljty2 时间: 2022-6-26 15:11

bluewhale 发表于 2022-6-26 10:47
openmpi 4.1.1是如何安装的？

先装gfortran，剩下的参考卢老师博文量子化学程序ORCA的安装方法

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