wzkchem5 发表于 2021-11-15 20:38
你要求两者分别的体积和表面积,还是两者的总体积、总表面积?因为两者在一起的时候电子云会有一点重叠,总 ...
naoki 发表于 2021-11-15 22:28
好像不关MD什么事,可以看看Sob老师博文
谈谈分子体积的计算http://sobereva.com/102
使用Multiwfn和VMD ...
sobereva 发表于 2021-11-15 23:12
这跟MD没有关系
怎么算你截图里的面积和体积,3L的链接里已经说了。
如果你是要算MD过程中每一帧的面积和 ...
wzkchem5 发表于 2021-11-15 20:38
你要求两者分别的体积和表面积,还是两者的总体积、总表面积?因为两者在一起的时候电子云会有一点重叠,总 ...
晓滨MD 发表于 2021-11-17 10:21
再请问老师,如果我要计算离子液体的总体积和表面积,可以拿优化出来的几何构型直接计算吗?
wzkchem5 发表于 2021-11-17 18:11
要做构型搜索,确保计算用的是最稳定构型
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