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标题: MS模拟MOF材料对C6烷烃的吸附，烷烃的联合立场模型该怎么简历呢 [打印本页]

作者
Author: ziyouren 时间: 2021-11-16 20:42
标题: MS模拟MOF材料对C6烷烃的吸附，烷烃的联合立场模型该怎么简历呢
刚接触，小白一个，希望各位老师解答。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-11-17 02:35
我并不用M$，但没有理由非要用联合原子力场

作者
Author: naoki 时间: 2021-11-17 17:56
mesocite粗粒化，martini力场跑动力学

作者
Author: ziyouren 时间: 2021-11-18 14:18

sobereva 发表于 2021-11-17 02:35
我并不用M$，但没有理由非要用联合原子力场

好的，我再研究一下，谢谢老师

作者
Author: ziyouren 时间: 2021-11-18 14:20

naoki 发表于 2021-11-17 17:56
mesocite粗粒化，martini力场跑动力学

请问这样做的依据是什么呢，我刚接触不是很了解。

作者
Author: naoki 时间: 2021-11-18 14:28

ziyouren 发表于 2021-11-18 14:20
请问这样做的依据是什么呢，我刚接触不是很了解。

不好意思啊我瞎了，你是要做联合力场，我看成粗粒化了。俺觉得你这个体系不需要用联合力场，全原子分子力场就好了

作者
Author: ziyouren 时间: 2021-11-18 15:00

naoki 发表于 2021-11-18 14:28
不好意思啊我瞎了，你是要做联合力场，我看成粗粒化了。俺觉得你这个体系不需要用联合力场，全原子分子力 ...

谢谢老师的解答，我很想知道这些力场是怎么建立的，比如我这C6烷烃，我看文献中会有一些键伸缩参数，扭转参数，这些都是在哪设置或者修改的呢，我只是用MS模拟一下C6烷烃的吸附过程做一下论文，但又因为刚接触，好些问题不知道该从哪下手。

作者
Author: naoki 时间: 2021-11-18 16:51

ziyouren 发表于 2021-11-18 15:00
谢谢老师的解答，我很想知道这些力场是怎么建立的，比如我这C6烷烃，我看文献中会有一些键伸缩参数，扭转 ...

非要用M$的话，Forcite模块可以选择自己定义或下载的格式合适的力场。导入之后如果你想手动修改力场参数，也可以用Forcite模块里面的Forcefield manager改。别的俺也不懂了

作者
Author: ziyouren 时间: 2021-11-18 18:11

naoki 发表于 2021-11-18 16:51
非要用M$的话，Forcite模块可以选择自己定义或下载的格式合适的力场。导入之后如果你想手动修改力场参数 ...

非常感谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2021-11-19 05:17

ziyouren 发表于 2021-11-18 15:00
谢谢老师的解答，我很想知道这些力场是怎么建立的，比如我这C6烷烃，我看文献中会有一些键伸缩参数，扭转 ...

直接用COMPASS之类力场就完了，力场参数会自动分配

作者
Author: ziyouren 时间: 2021-11-22 10:13

sobereva 发表于 2021-11-19 05:17
直接用COMPASS之类力场就完了，力场参数会自动分配

好的谢谢老师

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