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标题: 求助oniom计算OM/MM如何设置电荷与多重度？ [打印本页]

作者
Author: hhhnano 时间: 2021-11-19 12:12
标题: 求助oniom计算OM/MM如何设置电荷与多重度？
本帖最后由 hhhnano 于 2021-11-19 12:13 编辑

我在用oniom法优化结构时，不知道如何设置QM和MM区的电荷，我的体系带1个正电荷，用cl-中和后电荷为零，QM区配体电荷为零，另外三个残基为ser146,glu240,HIS270，总电荷为0，MM区电荷设为0.
请各位老师指教。

0 2 0 1 0 1

报错：
Read MM parameter file:
Wanted a string as input.
Found an integer as input.
4
?
Error termination via Lnk1e in /home/xzhfood/gaussian/g09/l101.exe at Thu Nov 18 23:01:04 2021.

附件是输入文件

作者
Author: sobereva 时间: 2021-11-20 08:40
你写了=hardfirst又不指定读入的力场参数，可不得报错
而且这年头还用PM3算这种体系完全不可思议

直接用簇模型完了，省事得多
要善用簇模型，不要盲目用ONIOM算蛋白质-小分子相互作用问题
http://sobereva.com/597

作者
Author: hhhnano 时间: 2021-11-20 16:19
谢谢SOB老师指导，我本想将molUP和TAO联合起来使用，估计比较麻烦，我这就学习一下您说的簇模型。

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