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标题: 做NPA电荷分析问题求助 [打印本页]

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小傻样样样    时间: 2021-11-22 14:24
标题: 做NPA电荷分析问题求助
首次接触到电荷分析领域,计算时写了pop=npa,但输出文件不知道怎么看,求指导。


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zjxitcc    时间: 2021-11-22 14:44
输出文件中Summary of Natural Population Analysis:下方表格里Natural Charge那一列就是NPA电荷
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小傻样样样    时间: 2021-11-22 16:13
zjxitcc 发表于 2021-11-22 14:44
输出文件中Summary of Natural Population Analysis:下方表格里Natural Charge那一列就是NPA电荷

找到了,谢谢指导
作者
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Hear    时间: 2021-12-20 19:30
zjxitcc 发表于 2021-11-22 14:44
输出文件中Summary of Natural Population Analysis:下方表格里Natural Charge那一列就是NPA电荷

老师,您好!我的输出文件中关于Summary of Natural Population Analysis那部分出现了三次,另外我用gaussview打开输出文件查看NBO的电荷分布,原子上显示的电荷数是我输出文件里第一次出现Summary of Natural Population Analysis:下方表格里Natural Charge的那一列。我不太清楚NPA电荷应该看输出文件中算的第一次还是第三次
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zjxitcc    时间: 2021-12-20 19:40
Hear 发表于 2021-12-20 19:30
老师,您好!我的输出文件中关于Summary of Natural Population Analysis那部分出现了三次,另外我用gaus ...

这是由于你算的是开壳层体系,输出的三次分别是基于总密度做的分析、基于alpha电子密度做的分析、基于beta电子密度的。第二者的贡献+第三者的贡献等于第一者的值,即后两个是第一个的组成部分。

如果你仅需要某个原子上的NPA电荷,就看基于总密度做分析算出的结果即可。
作者
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Hear    时间: 2021-12-20 20:39
zjxitcc 发表于 2021-12-20 19:40
这是由于你算的是开壳层体系,输出的三次分别是基于总密度做的分析、基于alpha电子密度做的分析、基于bet ...

明白啦,非常感谢老师的回答
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szy929    时间: 2024-5-23 16:41
zjxitcc 发表于 2021-12-20 19:40
这是由于你算的是开壳层体系,输出的三次分别是基于总密度做的分析、基于alpha电子密度做的分析、基于bet ...

老师我想请教一下,我做福井函数的时候是计算NPA0、NPA+1、NPA-1三种,然后算出来Summary of Natural Population Analysis代入福井函数公式,得出亲核亲电自由基三种进攻位点,我的NPA0文件中可以找到您说的这三次Summary of Natural Population Analysis,但是我在NPA+1和-1文件中各能找到九次,那我在计算时应该选取哪一次的Summary of Natural Population Analysis呢?
作者
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szy929    时间: 2024-5-23 16:44
这是我计算NPA电荷时的gjf和out文件,希望老师能看一下
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zhangxinxin    时间: 2025-7-14 17:58
zjxitcc 发表于 2021-11-22 14:44
输出文件中Summary of Natural Population Analysis:下方表格里Natural Charge那一列就是NPA电荷

请问计算NPA的关键词是什么?需要结构优化吗
作者
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zjxitcc    时间: 2025-7-14 18:37
本帖最后由 zjxitcc 于 2025-7-14 18:39 编辑
zhangxinxin 发表于 2025-7-14 17:58
请问计算NPA的关键词是什么?需要结构优化吗

关键词是pop=NPA,这个帖子一开头提问的人就说了。是否需要结构优化 看研究问题/分析目的而定。打个比方,你问我下一顿饭要不要用刀叉,我不知道你要吃中餐、西餐还是什么手抓饭,自然就没法回答你要不要用刀叉。
作者
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zhangxinxin    时间: 2025-7-14 19:14
zjxitcc 发表于 2025-7-14 18:37
关键词是pop=NPA,这个帖子一开头提问的人就说了。是否需要结构优化 看研究问题/分析目的而定。打个比方 ...

好的谢谢,那如果是闭壳层的话还需要写关键词pop=full吗?
作者
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zjxitcc    时间: 2025-7-14 19:53
zhangxinxin 发表于 2025-7-14 19:14
好的谢谢,那如果是闭壳层的话还需要写关键词pop=full吗?

我不知道你是否看错了帖子、还是回复错了帖子。无论体系是闭壳层/开壳层,获取NPA电荷只需要关键词pop=NPA,都不需要pop=full
作者
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zhangxinxin    时间: 2025-7-14 20:23
zjxitcc 发表于 2025-7-14 19:53
我不知道你是否看错了帖子、还是回复错了帖子。无论体系是闭壳层/开壳层,获取NPA电荷只需要关键词pop=NP ...

是不是算闭壳层的CDA电荷才需要加pop=full?
作者
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sobereva    时间: 2025-7-15 06:20
zhangxinxin 发表于 2025-7-14 20:23
是不是算闭壳层的CDA电荷才需要加pop=full?

根本没有叫CDA电荷的东西

如果你是指CDA分析,对于Gaussian用户强烈建议直接基于fch文件做,完全不需要pop=full,仔细看下文
使用Multiwfn做电荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互作用图
http://sobereva.com/166
作者
Author:
zhangxinxin    时间: 2025-7-15 16:09
sobereva 发表于 2025-7-15 06:20
根本没有叫CDA电荷的东西

如果你是指CDA分析,对于Gaussian用户强烈建议直接基于fch文件做,完全不需 ...

您好请问是基于结构优化后的fchk文件做还是直接单点能优化的fchk文件?然后可以直接用multifn做吗?
作者
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sobereva    时间: 2025-7-16 08:51
zhangxinxin 发表于 2025-7-15 16:09
您好请问是基于结构优化后的fchk文件做还是直接单点能优化的fchk文件?然后可以直接用multifn做吗?

没有叫multifn的东西

CDA分析的流程在博文里已经说得很清楚了
根本不存在叫做“单点能优化”的任务




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