计算化学公社
标题:
研究方向问题请教
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作者Author:
wangy0822
时间:
2021-11-22 16:07
标题:
研究方向问题请教
大家好,本人方向是做太赫兹光谱的,研二,前两天刚开题,主要内容是实验结合理论,把实验上测得的物质用Gaussian或者VASP算一下,但是只有这个工作量确实不够,然后和导师商量之后除了上面的内容又加了一些内容,就是做不同混合比例的混合物的光谱,其实物质基本确定了,就是葡萄糖和果糖(两组分做完还会做三组分),按照不同比例混合和几组,然后结合机器学习的方法来预测未知混合物配比(课题组里有个老师专门做机器学习的)。其实两组分实验也做完了,因为本人对机器学习不懂,不知道把已有的实验数据输入机器学习是全部光谱数据都输入吗?我的数据存在一个问题,就是比如葡萄糖在1.3THz处有一个吸收峰,但是这个峰的强度随着葡萄糖比例的上升不成一个线性关系,有时还会下降。这个问题问过老师,老师说就是不成线性所以才预测,没啥问题。我也不太懂,到底有没有问题,想请问下大家。我看文献上预测的有采用偏最小二乘回归的,大家有没有什么高见。
目前其实我葡萄糖,果糖实验基本做完,理论计算用Gaussian算了单分子,团簇模型(有4分子团簇;有18分子团簇,中间三个放开,外层15个固定)。用VASP算了周期性结构(用了opt-B88,opt-B86,opt-PBE),但是存在一个问题,我们的实验仪器在1.5THz以后基本没信号,而计算我看和别人文献上对应的其实可以(0-4THz),所以我能不能发篇这样的文章,就是把用Gaussian算的自己VASP算的做个对比,然后实验的结果用别的文献上的(加个引用),请大家给个建议,文章不要求有多好的期刊,发出去就行。。。毕业要求。。基本做完,理论计算用Gaussian算了单分子,团簇模型(有4分子团簇;有18分子团簇,中间三个放开,外层15个固定)。用VASP算了周期性结构(用了opt-B88,opt-B86,opt-PBE),但是存在一个问题,我们的实验仪器在1.5THz以后基本没信号,而计算我看和别人文献上对应的其实可以(0-4THz),所以我能不能发篇这样的文章,就是把用Gaussian算的自己VASP算的做个对比,然后实验的结果用别的文献上的(加个引用),请大家给个建议,文章不要求有多好的期刊,发出去就行。。。毕业要求。。
感谢大家解答
作者Author:
wzkchem5
时间:
2021-11-22 16:33
预测双组分混合物配比我觉得用kernel ridge regression(KRR)就行了,注意训练集一定要包括纯葡萄糖和纯果糖,因为KRR不太适合外推,而只适合内插。
如果要结合计算的话,我觉得还是要阐释实验峰产生的机理才行,比如为什么在某个地方有一个峰,能不能由这个峰的位置和强度知道这个糖有什么结构特征、是什么晶型,为什么能知道这些信息。我觉得这些才比较重要。只是重复出实验的谱图的话,除了说明算得准、实验大概率没做错以外,对实验没有任何的指导作用。
作者Author:
wangy0822
时间:
2021-11-22 20:34
wzkchem5 发表于 2021-11-22 16:33
预测双组分混合物配比我觉得用kernel ridge regression(KRR)就行了,注意训练集一定要包括纯葡萄糖和纯果 ...
感谢您的解答,其实现在基本所有文章都是理论和实验对照就可以了,就是在理论上看一下实验上的峰对应什么振动模式,至于您说的这些,还需要进一步的探索吧
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