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标题: 关于如何计算“自由基+自由基=分子”反应速率常数 [打印本页]

作者
Author: 594yy 时间: 2021-11-22 21:31
标题: 关于如何计算“自由基+自由基=分子”反应速率常数
本人现在想计算NH2+H2CCCH=H2CCCHNH2的反应速率，Sob老师说过两个自由基结合生成分子无过渡态，无过渡态应当如何计算该反应的反应速率常数？
Sob老师在这个贴子里”http://bbs.keinsci.com/thread-7578-1-1.html“说过如何计算无过渡态情况下均裂反应速率，可是对于合成速率常数应当如何计算？
望各位老师不惜赐教，谢谢。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-11-22 22:11
本帖最后由 wzkchem5 于 2021-11-23 08:52 编辑

首先，两个自由基结合的反应只是一般没有过渡态，不排除个别情况下有过渡态。所以还是值得找一下过渡态看看。
如果确实没有过渡态，那么取决于你需要的精度：
（1）如果准到比如说正负2个数量级就可以，那么把两个分子近似成球体，按硬球碰撞的公式算就行了，其中球的半径从计算出来的分子体积按球体积公式反推得到；
（2）如果要准到1个数量级左右，用Baik的方法（DOI: 10.1021/acs.organomet.8b00456）；
（3）如果需要更高精度，用VRC-TST（DOI: 10.1063/1.1539035）或AIMD。

作者
Author: 594yy 时间: 2021-11-22 22:54

wzkchem5 发表于 2021-11-22 22:11
首先，两个自由基结合的反应只是一般没有过渡态，不排除个别情况下有过渡态。所以还是值得找一下过渡态看看 ...

非常感谢wzk老师全面解答，我用柔性扫描计算过了，确实没有找到相对应的过渡态。
本人对计算精度要求不高，第一个方法是不是相对应比较简单，我想先用第一个方法试算一下。第一个方法我没有接触过，所以请问wzk老师有相关的方法介绍吗？或者相关方法搜索关键词？十分感谢！

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-11-22 23:47

594yy 发表于 2021-11-22 15:54
非常感谢wzk老师全面解答，我用柔性扫描计算过了，确实没有找到相对应的过渡态。
本人对计算精度要求不 ...

可以看一下https://en.wikipedia.org/wiki/Diffusion-controlled_reaction

作者
Author: 阿甘 时间: 2021-11-23 08:39

wzkchem5 发表于 2021-11-22 23:47
可以看一下https://en.wikipedia.org/wiki/Diffusion-controlled_reaction

老师，您前一个回复提到的（2）的文献是Baik的"Pitfalls in Computational Modeling of Chemical Reactions and How To Avoid Them"这篇吗？

作者
Author: 594yy 时间: 2021-11-23 08:52

wzkchem5 发表于 2021-11-22 23:47
可以看一下https://en.wikipedia.org/wiki/Diffusion-controlled_reaction

好的，十分感谢wzk老师。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-11-23 08:52

wzkchem5 发表于 2021-11-22 22:11
首先，两个自由基结合的反应只是一般没有过渡态，不排除个别情况下有过渡态。所以还是值得找一下过渡态看看 ...

DOI: 10.1021/acs.organomet.8b0045应该是DOI: 10.1021/acs.organomet.8b00456

作者
Author: 594yy 时间: 2021-11-23 10:11

wzkchem5 发表于 2021-11-22 22:11
首先，两个自由基结合的反应只是一般没有过渡态，不排除个别情况下有过渡态。所以还是值得找一下过渡态看看 ...

wzk老师，我想请问下关于VRC-TST理论，有相关软件可以实现计算吗？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-11-23 15:52

sobereva 发表于 2021-11-23 01:52
DOI: 10.1021/acs.organomet.8b0045应该是DOI: 10.1021/acs.organomet.8b00456

抱歉粘漏了一位，已改

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-11-23 15:52

594yy 发表于 2021-11-23 03:11
wzk老师，我想请问下关于VRC-TST理论，有相关软件可以实现计算吗？

Polyrate可以

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