计算化学公社

标题: 寻找势能面上全部极小点、过渡态的方法GRRM简介（幻灯片） [打印本页]

作者
Author: sobereva 时间: 2016-2-2 00:16
标题: 寻找势能面上全部极小点、过渡态的方法GRRM简介（幻灯片）
这是老夫对GRRM方法的非官方个人归纳，主要是怕自己以后遗忘相关知识才做的。然而老夫却从未有机会试用过GRRM程序，因此若被本幻灯片误导概不负责

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作者
Author: smutao 时间: 2016-2-2 02:03
有意思!
谢谢分享
可以从图中看到搜索过程中分子的拓扑结构已经发生了很明显的变化
有点类似于基于原子的团簇结构搜索
@梦藏秋
看看ABCluster能不能搞个类似的功能

作者
Author: 袁文凯GRRM 时间: 2016-2-2 09:58
中国可以联系我们。。。。

作者
Author: coolrainbow 时间: 2016-2-6 05:55

smutao 发表于 2016-2-2 02:03
有意思!
谢谢分享
可以从图中看到搜索过程中分子的拓扑结构已经发生了很明显的变化

看样子很有趣，而想得到这个软件看来十分不容易。
看了下原始文献，算法不算太难但实现起来还是需要费些力气的

作者
Author: 北纬18° 时间: 2016-4-20 23:51

袁文凯GRRM 发表于 2016-2-2 09:58
中国可以联系我们。。。。

你们是哪里？

作者
Author: 袁文凯GRRM 时间: 2016-4-24 20:11

北纬18° 发表于 2016-4-20 23:51
你们是哪里？

北京，

作者
Author: xiemin821 时间: 2016-4-25 10:13
这个程序我用过，挺好用的，可以计算出分子的各个过渡态和稳定态，但是比较费时

作者
Author: alwens 时间: 2016-4-28 08:19
现在orca很流行。

作者
Author: YUANBOWEI 时间: 2021-5-31 02:38

xiemin821 发表于 2016-4-25 10:13
这个程序我用过，挺好用的，可以计算出分子的各个过渡态和稳定态，但是比较费时

老师您现在还在使用这个程序吗

作者
Author: xiemin821 时间: 2021-5-31 13:14

YUANBOWEI 发表于 2021-5-31 02:38
老师您现在还在使用这个程序吗

还在用的，我已经向作者他们购买程序了

作者
Author: YUANBOWEI 时间: 2021-5-31 15:00

xiemin821 发表于 2021-5-31 13:14
还在用的，我已经向作者他们购买程序了

老师，方便深入讨论下吗？我也想购买这个软件，一些问题想请教一下

作者
Author: ikea1984 时间: 2021-5-31 22:45

xiemin821 发表于 2021-5-31 13:14
还在用的，我已经向作者他们购买程序了

多少钱能买一套啊

作者
Author: xiemin821 时间: 2021-6-1 10:17

ikea1984 发表于 2021-5-31 22:45
多少钱能买一套啊

挺便宜的，好像是一万日元三年，记得不大清楚了，你进他们主页，问问他们就行。

作者
Author: YUANBOWEI 时间: 2021-6-1 14:07

xiemin821 发表于 2021-6-1 10:17
挺便宜的，好像是一万日元三年，记得不大清楚了，你进他们主页，问问他们就行。

旅途费比较贵吧

作者
Author: ikea1984 时间: 2021-6-10 08:26

YUANBOWEI 发表于 2021-6-1 14:07
旅途费比较贵吧

这是啥？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-6-16 01:11

ikea1984 发表于 2021-6-10 08:26
这是啥？

以前听说必须日本方面派人来上门安装，需要装个好像是USB的什么秘钥才能用

作者
Author: ikea1984 时间: 2021-6-28 22:10

sobereva 发表于 2021-6-16 01:11
以前听说必须日本方面派人来上门安装，需要装个好像是USB的什么秘钥才能用

这日本人是想趁机满世界免费旅游吧。。。。

作者
Author: YUANBOWEI 时间: 2021-7-2 13:36
Sob老师，GRRM调用高斯是生成的这种文件。但是计算速度太慢了，想请教老师能否用XTB去计算这种问题呢？

%chk=TJ07_P0_MO.chk
%nproc=4
%mem=100MW
#p B3LYP/def2sv
guess=read scf=(xqc,maxcon=128,maxcyc=512,conver=8) force IOp(1/10=10) IOp(1/18=10) IOp(2/15=3) IOp(2/12=1)

force calculation: 1 0 0 0 0

1 3
Ta    0    -0.419443848683    -0.578823107669    -0.680865457925
S    0    3.597061196012    -0.448408339505    1.655640814857
N    0    2.260428225089    -0.491822431539    0.877950865590
N    0    1.242277615346    -0.524196605987    0.286454720763

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-7-2 20:54

YUANBOWEI 发表于 2021-7-2 06:36
Sob老师，GRRM调用高斯是生成的这种文件。但是计算速度太慢了，想请教老师能否用XTB去计算这种问题呢？

...

你这种体系估计xtb可靠性不高。甚至不说xtb，像你现在这个用B3LYP/def2-SV而不给基组加极化函数，可靠性都比较堪忧。。。

作者
Author: YUANBOWEI 时间: 2021-7-2 22:20

wzkchem5 发表于 2021-7-2 20:54
你这种体系估计xtb可靠性不高。甚至不说xtb，像你现在这个用B3LYP/def2-SV而不给基组加极化函数，可靠性 ...

嗯，如果是利用ORCA的接口呢？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-7-2 22:34

YUANBOWEI 发表于 2021-7-2 15:20
嗯，如果是利用ORCA的接口呢？

如果GRRM有现成的ORCA接口的话，倒是可以通过ORCA调用xtb。但是主要问题还是在于计算结果的可靠性，如果你连B3LYP/def2-SVP都跑不动，需要去掉极化函数才能跑得动的话，那估计很难有跑得动又可靠的方法。

作者
Author: YUANBOWEI 时间: 2021-7-2 23:09
他没有接口，需要自己写，其实还是能跑得动，就是慢

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