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标题: 求助，如何在分析溶剂可及表面积的时候得到不同原子对于SAS的贡献 [打印本页]

作者
Author: yingbin 时间: 2021-11-27 21:04
标题: 求助，如何在分析溶剂可及表面积的时候得到不同原子对于SAS的贡献
在文献中看见别人得到不同原子对于溶剂可及表面积的贡献情况，与使用gmx -oa得出的好像不太一样，想请教下各位大神这种是怎么得到的。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-11-28 13:25
gmx sasa后面跟上-output {选择语句}，来得到选择语句对应的原子暴露在表面的那部分表面积

例如

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举一反三

作者
Author: yingbin 时间: 2021-11-28 17:40

sobereva 发表于 2021-11-28 13:25
gmx sasa后面跟上-output {选择语句}，来得到选择语句对应的原子暴露在表面的那部分表面积

例如

请问老师，如果我要分析氢（H）对于SAS的贡献，具体命令要怎么输入实现呢？-output后面输入H还是全称呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-12-2 06:03

yingbin 发表于 2021-11-28 17:40
请问老师，如果我要分析氢（H）对于SAS的贡献，具体命令要怎么输入实现呢？-output后面输入H还是全称呢？

看语法说明https://manual.gromacs.org/docum ... elp/selections.html

作者
Author: yingbin 时间: 2021-12-2 22:24

sobereva 发表于 2021-12-2 06:03
看语法说明https://manual.gromacs.org/documentation/2020/onlinehelp/selections.html

谢谢老师！学到了

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