计算化学公社

标题: 平时跑高斯，性价比方面请教值不值得买下面贵的那个 [打印本页]

作者
Author: Qingming 时间: 2021-11-30 20:16
标题: 平时跑高斯，性价比方面请教值不值得买下面贵的那个
本帖最后由 Qingming 于 2021-12-5 20:28 编辑

这是按sob老师的博文http://sobereva.com/444配的，商家给的报价，纠结要不要买贵的那个，值不值得买贵的, 还是说便宜的那个也完全够用了，平时跑高斯更新：

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2021-11-30 20:41
如果需要同时跑很多任务，并且预算很充足，就可以买双路7742。
现在第三代可扩展至强也已经能买到了，可以考虑双路8375C，共64c 128t，性能介于你这两套之间，能达到双路7742的70%左右，4w左右就能配下来，性价比超高。TDP 300W，需要很好的散热，要离工作区域远一点，不然太吵。

作者
Author: abin 时间: 2021-11-30 21:20
本帖最后由 abin 于 2021-12-1 11:35 编辑

高斯，目前的版本，顶多利用到AVX2指令集……
这里两老设备，无非就是核心多少的问题，以及一个核心平均分配多少内存。

我自己，会买这里的intel设备两套，
连起来用。就是我之前提过的双机迷你集群。

没有机房而且是公用工作室的话，
选热功率低的，
会大大降低被白眼的几率。

作者
Author: Qingming 时间: 2021-12-1 10:54

abin 发表于 2021-11-30 21:20
高斯，目前的版本，顶多利用到AVX2指令集……
这里两老设备，无非就是核心多少的问题，以及一个核心评论分 ...

谢谢，我也更倾向两套8273cl,但是我担心用四五年后会变的很慢，我的担心是否多余？或者把8273提升为8375 2.9G 32核是否有必要呢？

作者
Author: Qingming 时间: 2021-12-1 10:58

Entropy.S.I 发表于 2021-11-30 20:41
如果需要同时跑很多任务，并且预算很充足，就可以买双路7742。
现在第三代可扩展至强也已经能买到了，可以 ...

也有考虑8375，和两台8273集群比，不知哪套好？还有，我是打算用很多年，8273会不会用过几年后就变得很慢，和家用电脑一样。。。

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2021-12-1 11:43

Qingming 发表于 2021-12-1 10:58
也有考虑8375，和两台8273集群比，不知哪套好？还有，我是打算用很多年，8273会不会用过几年后就变得很慢 ...

两台双路8273CL的性能总和比一台双路8375C强一些，如果两台一起跑一个任务，会有比较大的并行损耗，实际可能不如一台双路8375C，另外，两台机器维护起来会比一台麻烦点。
家用电脑用几年变卡是因为臃肿的windows操作系统和windows生态下一大堆毒瘤软件。Linux环境根本无此担忧。Linux环境卡顿最常见的原因是硬盘I/O瓶颈，多数消费级SSD写入大文件或接近满盘状态时掉速严重，配个PCIe 4.0 NVME U.2接口的企业级SSD（比如intel D7 P5510），这种问题也就没有了

作者
Author: abin 时间: 2021-12-1 11:44

Qingming 发表于 2021-12-1 10:54
谢谢，我也更倾向两套8273cl,但是我担心用四五年后会变的很慢，我的担心是否多余？或者把8273提升为8375 ...

按照芯片更新迭代的速度,
大概18个月就会被被淘汰了.

一般而言, 经费不足的情形下, 一套设备, 使用3~4年, 就达到目的了.

要足够快, 需要钱来支撑的.

像我这种没钱的, 2686v4搞了一堆, 反正不用交电费,
慢条斯理的算呗.
比起新出的处理器来,肯定慢呀.
AMD 7742双路, 我询价的时候, 11万一套; 可是双路2686v4, 1.2万一套.
跑高斯, 7742双路, 也没有比2686v4, 快8倍以上呀.
所以, 在这种简单的比较之后, 选择了2686v4这种淘汰的垃圾.

我自己也有10年前的电脑, 运行ubuntu, 依旧能稳定工作....

考虑计算快慢, 也要结合自己的使用场景和计算流程.
比如, 现在一个计算流程是8小时搞定; 换新机器, 很快啊, 1小时搞定.
那么, 1小时搞定计算后, 你能否及时处理后续的事情? 处理后续事情的时候, 机器是否会空闲?

如果算的快的机器, 大部分时间都在空闲, 那就没啥实际意义了.

如果能合理压缩机器空闲时间,
任务量很大, 当然是跑得快的机器, 更合算了.

当然了, 如果一个计算, 老机器跑10天, 新机器, 3天不到就搞定了, 还是买新机器了.

作者
Author: sai77 时间: 2021-12-1 12:10
第二套和我前几个月买的基本一样..我买的要三万多= =

作者
Author: Qingming 时间: 2021-12-1 14:13

abin 发表于 2021-12-1 11:44
按照芯片更新迭代的速度,
大概18个月就会被被淘汰了.

谢谢，说的很有道理，上面8273CL这套，内存换成32G的，是否有必要呢

作者
Author: Qingming 时间: 2021-12-1 14:15

Entropy.S.I 发表于 2021-12-1 11:43
两台双路8273CL的性能总和比一台双路8375C强一些，如果两台一起跑一个任务，会有比较大的并行损耗，实际 ...

好的，谢谢你，所以还是有必要换成8375是吧

作者
Author: Qingming 时间: 2021-12-1 15:03
这是升级成8375C的，内存也换成16*32报价，请各位看看这样配置是否合理

作者
Author: Qingming 时间: 2021-12-1 15:05

abin 发表于 2021-12-1 11:44
按照芯片更新迭代的速度,
大概18个月就会被被淘汰了.

请看一下我最新的8375c的配置，看下配置和价格是否合理，比8273速度能提升多少

作者
Author: Qingming 时间: 2021-12-1 15:06

sai77 发表于 2021-12-1 12:10
第二套和我前几个月买的基本一样..我买的要三万多= =

感觉咋样，计算的快不快

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2021-12-1 15:18

Qingming 发表于 2021-12-1 14:15
好的，谢谢你，所以还是有必要换成8375是吧

这个根据你的散热条件来选，如果不能接受很大的噪音，就不必用8375C了。
8375C需要很强的散热，能压的散热器规格都很大，风扇转速也高，注意让商家配个好散热。
用双路8375C的话，内存可选16*16GB或16*32GB（第三代可扩展至强支持8通道内存），如果需要跑内存需求极大的任务，应该上16*32GB，否则16*16GB就够用。注意要3200MHz频率。
第三代可扩展至强支持PCIe 4.0，如果要跑的任务也对硬盘有很大需求，可以和商家沟通用intel D7 P5510，这盘很强，价格也还可以，3.84TB不到5000元。硬盘需求不大的话，买浦科特M10P 1TB或2TB就行，JD自营1TB价格是1.1k

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2021-12-1 15:38

Qingming 发表于 2021-12-1 15:03
这是升级成8375C的，内存也换成16*32报价，请各位看看这样配置是否合理

忘记刷新页面了，没看到这张图……
你需要和商家再三确认，散热器是否能稳压300W的8375C。
电源太低了，换成海韵FOCUS GX850。
硬盘和内存的选择如我上一条所说。当然也不是非得浦科特M10P，PM 9A1便宜，也可选。
关于机械硬盘，如果你手头没有大容量存储空间，4TB肯定是不够的，估计也就能装1个大课题的数据。希捷故障率是比较高的，历史上故障率最低的是日立，现已被西部数据收购，现在西部数据的Ultrastar DC HC系列就是以前的日立盘，推荐DC HC320（8TB，1000多元），想要更大的也可以选DC HC550（18TB，1900多元），不过有这种容量需求还不如装台NAS。其实量化的结果数据也不算多，我是做MD的，一篇文章就能有近10TB数据…
关于机箱，先马黑洞属于闷罐类型，实际用的时候要么开侧板，要么加满风扇，风扇可用利民TL-C12 Pro，性能很强，噪音不大。
这家的8375C有点贵，我在TB随便看了几家都是10000以内。

作者
Author: abin 时间: 2021-12-1 18:57

Qingming 发表于 2021-12-1 14:13
谢谢，说的很有道理，上面8273CL这套，内存换成32G的，是否有必要呢

有钱就换呗！

但凡拿不定主意，来问要不要大内存的，一般就用不到大内存的。

另，如果是经费购买，建议一步到位。
后续升级配置，不像家用机那么简单的。
我指报销流程。

作者
Author: abin 时间: 2021-12-1 18:57

Qingming 发表于 2021-12-1 15:05
请看一下我最新的8375c的配置，看下配置和价格是否合理，比8273速度能提升多少

没用过，没测试过，不敢瞎说。
所以无可奉告。

作者
Author: sai77 时间: 2021-12-2 08:45

Qingming 发表于 2021-12-1 15:06
感觉咋样，计算的快不快

还行，比之前用超算中心的快
但是提交的任务一多速度就慢得多了

作者
Author: Qingming 时间: 2021-12-2 18:01

sai77 发表于 2021-12-2 08:45
还行，比之前用超算中心的快
但是提交的任务一多速度就慢得多了

大概70个原子优化结构+计算频率大概需要多久啊

作者
Author: sobereva 时间: 2021-12-3 04:00

Qingming 发表于 2021-12-2 18:01
大概70个原子优化结构+计算频率大概需要多久啊

在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

作者
Author: sai77 时间: 2021-12-3 11:53
本帖最后由 sai77 于 2021-12-3 11:54 编辑

Qingming 发表于 2021-12-2 18:01
大概70个原子优化结构+计算频率大概需要多久啊

找了一下，还正好有一个结构70个原子整~
用了4核、8G内存，m062x/6-31g**，opt用时4小时18分，freq用时6小时30分。

作者
Author: Qingming 时间: 2021-12-3 12:20

sai77 发表于 2021-12-3 11:53
找了一下，还正好有一个结构70个原子整~
用了4核、8G内存，m062x/6-31g**，opt用时4小时18分，freq用时6 ...

为啥只用4核，8G, 不能全部用起来吗

作者
Author: sai77 时间: 2021-12-3 13:39

Qingming 发表于 2021-12-3 12:20
为啥只用4核，8G, 不能全部用起来吗

这是组里其他人提交的任务。
公用的服务器不能一个人把资源全占用吧，其他人还得提交任务

作者
Author: snljty 时间: 2021-12-3 14:40

sai77 发表于 2021-12-3 13:39
这是组里其他人提交的任务。
公用的服务器不能一个人把资源全占用吧，其他人还得提交任务

正确使用方法是弄个作业管理系统（排队系统）比如PBS或者SLURM，每个任务占全部资源，一个任务算完了自动再算下一个，而不是大家都挤在一起用。

作者
Author: sai77 时间: 2021-12-3 15:37

snljty 发表于 2021-12-3 14:40
正确使用方法是弄个作业管理系统（排队系统）比如PBS或者SLURM，每个任务占全部资源，一个任务算完了自动 ...

是装了个torque...但是还是按照之前在超算中心那样提交多个任务，让它慢慢算= =
一次算一个任务的话，有些任务是算反应过渡态，耗时太久；有些任务就简单优化个结构，等一晚上可以接受，等几天就不行了。

作者
Author: Qingming 时间: 2021-12-5 19:51
麻烦各位再看看这个配置和价格是否合理

作者
Author: Qingming 时间: 2021-12-5 19:51

abin 发表于 2021-12-1 18:57
没用过，没测试过，不敢瞎说。
所以无可奉告。

请再看下最新配置和价格，看是否合理

作者
Author: Qingming 时间: 2021-12-5 19:52

Entropy.S.I 发表于 2021-12-1 15:38
忘记刷新页面了，没看到这张图……
你需要和商家再三确认，散热器是否能稳压300W的8375C。
电源太低了 ...

请再看下最新配置和价格，看是否合理

作者
Author: abin 时间: 2021-12-5 21:03
本帖最后由 abin 于 2021-12-5 22:46 编辑

Qingming 发表于 2021-12-5 19:51
请再看下最新配置和价格，看是否合理

你的处理器支持PCIe 4.0吗？

确认一下。

如果处理器不支持PCIe4.0，
使用新硬盘也没啥意义呀！

我记忆中，当前服务器平台，
使用PCIe 4.0，要采用AMD平台的。

系统盘使用小容量硬盘，
是便于克隆。
这是我推荐的方案。
建议用SATA接口的，
配套工具也会便宜。

对于几乎不关机，内存也够大的Linux服务器，
是否使用固态硬盘做系统，
并不会明显影响操作体验。

其他方面，不懂，不评价。

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2021-12-6 00:59

Qingming 发表于 2021-12-5 19:51
麻烦各位再看看这个配置和价格是否合理

PM961是个鸡肋，应当去掉。
内存应当用3200MHz。
关于显卡，如果只做量化，没必要配，如果兼顾MD就可以配，预算充足甚至可以上3080Ti，这个CPU带3080Ti足够，跑MD速度是3070的1.7倍。
这家的价还不错

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2021-12-6 01:10

abin 发表于 2021-12-5 21:03
你的处理器支持PCIe 4.0吗？

确认一下。

火星了，Ice Lake内核的第三代XEON可扩展处理器全部支持PCIe 4.0，已经上市大半年了，早已可以买到。
现在Intel D7 P5510价格很实惠，3.84 TB全新只要5000元，用在读写密集的任务上很合适

作者
Author: abin 时间: 2021-12-6 07:49
本帖最后由 abin 于 2021-12-6 08:05 编辑

Entropy.S.I 发表于 2021-12-6 01:10
火星了，Ice Lake内核的第三代XEON可扩展处理器全部支持PCIe 4.0，已经上市大半年了，早已可以买到。
现 ...

三代，至少有两种，Ice Lake
Cooper Lake，
内存通道和PCIe规格有差异。

你说的没错，Ice Lake没问题。

补充一下,
使用300W功耗的机器需要留意,
保持稳定散热, 需要强劲的风扇, 甚至是暴力风扇.
声音不是一般人能忍受的.

有同事买过这种产品, 用了几天, 被隔了一堵墙的其他工作室的同学抱怨, 噪音太大,
机器让供货商拉走了. . .
注意, 是实心砖墙, 房间有空调的.

除非有隔音比较好, 散热比较好的房间, 否则, 可能遭遇不小的麻烦.

祝好.

作者
Author: Qingming 时间: 2021-12-6 08:47

Entropy.S.I 发表于 2021-12-6 00:59
PM961是个鸡肋，应当去掉。
内存应当用3200MHz。
关于显卡，如果只做量化，没必要配，如果兼顾MD就可以 ...

想着拿来单独装双系统用的

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