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标题: 使用Gromacs设置tc-grps如何实现输出protein和no protein的温度? [打印本页]

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yjb    时间: 2021-12-7 20:14
标题: 使用Gromacs设置tc-grps如何实现输出protein和no protein的温度?
设置一个蛋白质在水中的体系的模拟过程。用tc-grps = protein Non-protein 分别设置ref-t = 300 和 200,想看局部控温的情况,在输出文件中只看到protein和 Non protein的平均温度,并不能看到每一步的protein和Non protein的分别的控制温度,我应该怎么做才能实现protein 和 Non protein的温度都出现在输出文件中?



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sobereva    时间: 2021-12-8 00:02
看清楚板块再发贴,求助学术贴不得发到“公社大厅”板块,不要扰乱论坛秩序,公社大厅板块http://bbs.keinsci.com/forum-79-1.html版头超级巨大的红字都看不到么?这次给你移动了,下次如果普通学术求助帖再发到“公社大厅”板块,直接删帖+记违规+扣分处理。
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sobereva    时间: 2021-12-8 08:49
gmx energy从edr文件中可以提取指定的控温组的温度变化
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yjb    时间: 2021-12-8 09:08
sobereva 发表于 2021-12-8 00:02
看清楚板块再发贴,求助学术贴不得发到“公社大厅”板块,不要扰乱论坛秩序,公社大厅板块http://bbs.keins ...

感谢社长 下次一定注意
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yjb    时间: 2021-12-8 09:15
sobereva 发表于 2021-12-8 08:49
gmx energy从edr文件中可以提取指定的控温组的温度变化

谢谢 社长




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