计算化学公社

标题: 相互作用能中范德华作用能的本质是什么 [打印本页]

作者
Author: 418086011 时间: 2021-12-7 20:51
标题: 相互作用能中范德华作用能的本质是什么
Sob老师在分子动力学讲义中提到相互作用能的计算，其中包括LJ-SR项，即范德华作用能。同时，老师在博文http://sobereva.com/413中也提到过：“范德华作用”的本质包含了交换互斥和色散吸引作用两个部分，而一般说的范德华相互作用，以及pi-pi堆积作用的本质都是色散作用。请问老师：范德华作用能中所计算的能量大小是否包括pi-pi堆积作用（如果存在的话）？谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2021-12-8 08:39
如果你算pi-pi堆积体系间的范德华作用能，就可以解释为是pi-pi堆积作用能。

如果两个大体系只有一部分是pi-pi堆积的，比如http://bbs.keinsci.com/thread-26613-1-1.html里提到的文章里给出的下面的这种体系，由图橙红色区域是两个分子间pi-pi堆积部分，那么你用GROMACS或者Multiwfn的基于力场的能量分解（http://sobereva.com/442）计算红色片段间的范德华作用能，得到的就是这两个分子间pi-pi堆积部分对结合能产生的贡献。

(, 下载次数 Times of downloads: 19)

作者
Author: 418086011 时间: 2021-12-8 11:29

sobereva 发表于 2021-12-8 08:39
如果你算pi-pi堆积体系间的范德华作用能，就可以解释为是pi-pi堆积作用能。

如果两个大体系只有一部分是 ...

谢谢老师！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)