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标题: 求助：为什么用gromacs做高分子体系的能量最小化之后高分子全都散了？ [打印本页]

作者
Author: 邱美佳 时间: 2021-12-8 18:10
标题: 求助：为什么用gromacs做高分子体系的能量最小化之后高分子全都散了？
求助：为什么我用gromacs做高分子体系的能量最小化之后高分子全都散了？输入输出文件在附件里，麻烦各位老师帮我看看，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2021-12-9 06:50
我没时间细看，着重检查：
[molecules]里的分子顺序、[moleculetype]里的原子顺序是否和结构文件相符
[moleculetype]里有是否有缺参数的情况，是否该有的项都有
检查bond项的参数是否都在合理范围

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