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标题: 论文中使用ORCA应该引用哪篇参考文献？ [打印本页]

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Author: qlyfe 时间: 2021-12-14 17:23
标题: 论文中使用ORCA应该引用哪篇参考文献？
请问现在使用ORCA应该在论文中引用哪篇参考文献呢？是Wires Comput. Mol. Sci. 2, 73–78 (2012)还是J. Chem. Phys. 152, 224108 (2020) ?

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Author: wzkchem5 时间: 2021-12-14 18:53
本帖最后由 wzkchem5 于 2023-10-12 11:34 编辑

2018年（F. Neese: Software update: the ORCA program system, version 4.0 (WIREs Comput Mol Sci 2018,
8:e1327. doi: 10.1002/wcms.1327)）的文章是必引的（因为EULA要求），而且必须引在正文里，因为引在SI里不能增加这篇文章的引用数（参见https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=8&t=7813）。2012年和2020年的文章没有在EULA里规定强制引用，但是如果没有特殊原因，一般也要引用（也就是说这两篇不引用属于合法但不合理，2018年的文章不引用是不合法）。
此外也要注意恰当引用计算方法的文献，这个不仅是泛函、基组、溶剂模型、色散校正之类的问题，也包括加速算法，甚至包括默认开启的加速算法。例如从ORCA 5.0开始，杂化泛函计算默认用RIJCOSX，因此除非用户加了NoRIJCOSX，否则必须引RIJCOSX的文章，即便从来没写过RIJCOSX的关键词也是如此。

补充（2023.10.12）：现在最新的orca文章是2022年发表的（https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wcms.1606），如果用ORCA 5.0.x版本，应该引用这篇文章。因为EULA制定的时候2022年那篇文章还没有发，而EULA又不能轻易更改，所以如果看现在的EULA，会发现仍然说的是要引2018年那篇。所以orca的EULA某种意义上讲已经过时了，但是在EULA正式更新之前，当前的EULA仍然有法律效力。

作者
Author: qlyfe 时间: 2021-12-14 19:22

wzkchem5 发表于 2021-12-14 18:53
2018年（F. Neese: Software update: the ORCA program system, version 4.0 (WIREs Comput Mol Sci 2018, ...

明白了，谢谢！
在EULA的第五条里面有写，我之前都没仔细看

作者
Author: qlyfe 时间: 2022-4-26 12:32
ORCA5.0的文章也出了，不过EULA好像还没更新
Software update: The ORCA program system—Version 5.0 https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/wcms.1606

作者
Author: Caroline2022 时间: 2023-4-28 11:43

wzkchem5 发表于 2021-12-14 18:53
2018年（F. Neese: Software update: the ORCA program system, version 4.0 (WIREs Comput Mol Sci 2018, ...

老师，请问引用RIJCOSX的文章是哪一篇？因为不会技术上网（安装ORCA时就是找的国外朋友，现在不好意思再麻烦人家帮忙找了），因此也无法登录您提供的EULA网址https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=8&t=7813。如果您方便的话，能否回复我引用RIJCOSX文章的DOI？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-4-28 16:11

Caroline2022 发表于 2023-4-28 04:43
老师，请问引用RIJCOSX的文章是哪一篇？因为不会技术上网（安装ORCA时就是找的国外朋友，现在不好意思再 ...

这种不会在EULA里提，EULA只会说ORCA软件本身怎么引用。
RIJCOSX相关的文章有如下几篇
1 Neese, F.;  Wennmohs, F.;  Hansen, A.; Becker, U., Efficient, approximate and parallel Hartree–Fock and hybrid DFT calculations. A ‘chain-of-spheres’ algorithm for the Hartree–Fock exchange. Chem. Phys. 2009, 356 (1), 98-109.
2. Izsák, R.; Neese, F., An overlap fitted chain of spheres exchange method. J. Chem. Phys. 2011, 135 (14), 144105.
3. Izsák, R.;  Neese, F.; Klopper, W., Robust fitting techniques in the chain of spheres approximation to the Fock exchange: The role of the complementary space. J. Chem. Phys. 2013, 139 (9), 094111.
4. Helmich-Paris, B.;  de Souza, B.;  Neese, F.; Izsák, R., An improved chain of spheres for exchange algorithm. J. Chem. Phys. 2021, 155 (10), 104109.

作者
Author: Caroline2022 时间: 2023-4-28 18:11

wzkchem5 发表于 2023-4-28 16:11
这种不会在EULA里提，EULA只会说ORCA软件本身怎么引用。
RIJCOSX相关的文章有如下几篇
1 Neese, F.; W ...

谢谢大佬

作者
Author: 星纹c 时间: 2023-10-12 17:00

wzkchem5 发表于 2021-12-14 18:53
2018年（F. Neese: Software update: the ORCA program system, version 4.0 (WIREs Comput Mol Sci 2018, ...

你好，这些需要引用的文章在哪里更新汇总的呢？我看orca的输出文件里有一些，比如色散矫正、使用的基组啥的，可是你提的有一些我没有找到，这些信息哪里有汇总吗？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-10-12 17:39

星纹c 发表于 2023-10-12 10:00
你好，这些需要引用的文章在哪里更新汇总的呢？我看orca的输出文件里有一些，比如色散矫正、使用的基组 ...

输出文件会尽量总结那些用户容易忘记引的文献，而且越是新版的orca总结得就越全，但是很难完全总结。最靠谱的方法是参考几篇领域内高水平的计算文章，看他们是怎么引的

作者
Author: 星纹c 时间: 2023-10-12 18:02

wzkchem5 发表于 2023-10-12 17:39
输出文件会尽量总结那些用户容易忘记引的文献，而且越是新版的orca总结得就越全，但是很难完全总结。最靠 ...

好的，谢谢解答

作者
Author: ligninpyrolysis 时间: 2024-4-12 10:39

wzkchem5 发表于 2021-12-14 18:53
2018年（F. Neese: Software update: the ORCA program system, version 4.0 (WIREs Comput Mol Sci 2018, ...

谢谢

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