计算化学公社

标题: 求助对周期性边界条件审稿意见的回复 [打印本页]

作者
Author: 呆宝可乐 时间: 2021-12-15 20:37
标题: 求助对周期性边界条件审稿意见的回复
审稿人提到：“周期性边界条件在本文中是如何考虑的？作者需要进一步详细讨论。”这个问题一般怎么回答啊？模拟的是超临界CO2微乳液

作者
Author: zaqxs234 时间: 2021-12-15 22:45
采用周期性边界是为了提高计算速度，忽略了部分的非键作用力，降低了精度。审稿人的意思可能是问你为什么采用这个大小的周期性盒子？要不解释一下模拟体系的浓度、密度等参数与实验的对比数据，证明建立盒子的合理性

作者
Author: sobereva 时间: 2021-12-16 15:06
用PBC和提高计算速度没有必然联系，反倒是考虑PBC还会令耗时更高，因为需要计算更多的非键作用。当前体系必须用PBC，否则根本没法描述超临界二氧化碳状态。

而且用PBC和忽略非键作用完全没有直接联系。诸如通常使用的PME方式计算静电作用，实际效果相当于用了无穷大cutoff而考虑了无穷远的相互作用，原理上根本没有近似（虽然实际数值精度取决于傅里叶格点间距和实空间cutoff）。

其余部分，仔细看下文再问
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

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