标题: 有机小分子PSF文件出错 [打印本页] 作者Author: 上善若水 时间: 2021-12-18 19:14 标题: 有机小分子PSF文件出错 我想用charmm22力场做小分子的一个简单动力学模拟，但是psf文件一直配置不对。能查到的都是做蛋白质的psf文件，请问各位老师简单的有机分子psf文件该如何傻瓜式配置呢？
配图是同样charmm22在namd2的报错信息。psf是我用tcl脚本配置的。FATAL ERROR: Structure (psf) file is either in CHARMM format (with numbers for atoms types, the X-PLOR format using names is required) or the segment name field is empty.