计算化学公社

标题: 求助xtb任务不报错中断退出 [打印本页]

作者
Author: luzujia 时间: 2021-12-19 17:48
标题: 求助xtb任务不报错中断退出
在Linux系统上提交高斯和xtb任务，总是算到一半中断，输出文件并没有报错，而系统给发了一封提示邮件（You have mail in /var/spool/mail/root）。邮件最后部分贴在下面，麻烦各位大佬帮我看看是什么问题，感谢！~

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作者
Author: sobereva 时间: 2021-12-19 18:05
没细节没法说
xtb对什么体系怎么跑的任务、xtb具体版本、操作系统，这都是和当前问题直接相关的信息全都不交代

仔细看此文
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

作者
Author: luzujia 时间: 2021-12-19 18:32

sobereva 发表于 2021-12-19 18:05
没细节没法说
xtb对什么体系怎么跑的任务、xtb具体版本、操作系统，这都是和当前问题直接相关的信息全都不 ...

抱歉社长，是我没说清楚。操作系统是Centos 7.5.1804，高斯版本是g16C01，xtb版本是6.4.1。高斯算小分子可以正常结束，稍大体系（30个原子，优化频率分析 b3lyp/6-31g*）就中断，输出文件里没有报错信息；xtb的任务是重复社长您搜索remdesivir构象的md任务，也是算到一半中断，打开轨迹文件发现也输出了七八帧。我感觉应该是系统的问题，所有就没有注意描述计算细节。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-12-19 20:18
连Gaussian也这样，应该是运行环境的事。能重装尝试重装，装个CentOS 8 stream

作者
Author: luzujia 时间: 2021-12-19 21:36

sobereva 发表于 2021-12-19 20:18
连Gaussian也这样，应该是运行环境的事。能重装尝试重装，装个CentOS 8 stream

好的，谢谢社长！

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