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标题: namd怎么设置非周期性边界条件呢？ [打印本页]

作者
Author: wanghao12000 时间: 2021-12-20 22:51
标题: namd怎么设置非周期性边界条件呢？
请问各位老师，namd能不能设置非周期性边界条件呢？怎样设置呢？

作者
Author: fhh2626 时间: 2021-12-21 09:52
你不设周期性边界条件就是非周期性边界了

作者
Author: wanghao12000 时间: 2021-12-21 11:22

fhh2626 发表于 2021-12-21 09:52
你不设周期性边界条件就是非周期性边界了

哦哦，这样啊，谢谢老师

作者
Author: wanghao12000 时间: 2021-12-21 20:32

fhh2626 发表于 2021-12-21 09:52
你不设周期性边界条件就是非周期性边界了

老师请问一下您，这个我先系统能量最小化，然后再跑npt，为什么会出现这个
FATAL ERROR: Exiting prematurely ; see error messages above

作者
Author: fhh2626 时间: 2021-12-22 10:20

wanghao12000 发表于 2021-12-21 20:32
老师请问一下您，这个我先系统能量最小化，然后再跑npt，为什么会出现这个
FATAL ERROR: Exiting premat ...

这个不是错误信息，log文件里面这个的上面几行才是

作者
Author: wanghao12000 时间: 2021-12-22 12:12

fhh2626 发表于 2021-12-22 10:20
这个不是错误信息，log文件里面这个的上面几行才是

老师能不能给个conf，或者我把我的发出来您看一下哪些需要删

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