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标题: MD模拟时向溶液中添加离子取代水分子的问题 [打印本页]

作者
Author: Tifo 时间: 2021-12-21 16:13
标题: MD模拟时向溶液中添加离子取代水分子的问题
请问各位老师，在使用MD模拟电解质溶液时，以LAMMPS为例，常通过使用LAMMPS命令直接在已有的溶液模型中添加离子以改变溶液浓度，此时也要删掉一定数目的水分子。请问这个删掉的水分子数目如何确定，是和加入的离子数量一致吗？
文献中一般也只是提到一下，不说明具体取代个数

作者
Author: sobereva 时间: 2021-12-21 18:36
看你加什么离子，跟离子大小有关。原理上，加入离子后，溶剂分子倘若和插入的离子存在过近接触，相应的溶剂分子就要被去掉。可以基于调节的范德华半径等作为判据检验

作者
Author: Tifo 时间: 2021-12-21 20:34

sobereva 发表于 2021-12-21 18:36
看你加什么离子，跟离子大小有关。原理上，加入离子后，溶剂分子倘若和插入的离子存在过近接触，相应的溶剂 ...

谢谢sob老师，我也觉得可以考虑用范德华半径作为标准，主要是没有看到哪篇文献有明确表述

作者
Author: sobereva 时间: 2021-12-22 00:58

Tifo 发表于 2021-12-21 20:34
谢谢sob老师，我也觉得可以考虑用范德华半径作为标准，主要是没有看到哪篇文献有明确表述

没必要那么较真
显而易见的事不需要任何文章来支持

作者
Author: Tifo 时间: 2021-12-22 19:32

sobereva 发表于 2021-12-22 00:58
没必要那么较真
显而易见的事不需要任何文章来支持

好的谢谢老师

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