sobereva 发表于 2021-12-23 14:28
问题莫名其妙,怎么加的,加完了想干什么都要说清楚
wanghao12000 发表于 2022-2-16 16:00
老师,我想在VMD 中建的水盒子里面添加Licl,这个改怎么弄呢?建完模型之后再用NAMD计算,谢谢您
sobereva 发表于 2022-2-17 08:30
分子动力学初始结构构建程序Packmol的使用
http://sobereva.com/473(http://bbs.keinsci.com/thread-12 ...
wanghao12000 发表于 2022-2-17 12:30
谢谢老师,我想到这个办法了,但是LI离子的这个pdb文件去哪里找呢?谢谢老师
sobereva 发表于 2022-2-17 13:02
gview之类程序画一个保存
sobereva 发表于 2022-2-17 13:02
gview之类程序画一个保存
wanghao12000 发表于 2022-2-19 17:16
老师,我生成pdb文件了,要怎么生成psf文件啊,我用拓扑文件,只能生成水的psf,没有离子的psf文件,谢谢 ...
sobereva 发表于 2022-2-19 20:03
我不用NAMD
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