计算化学公社

标题: 求助:创建索引文件选择语句的书写问题 [打印本页]

作者
Author:
邱美佳    时间: 2021-12-26 13:39
标题: 求助:创建索引文件选择语句的书写问题
我用cp2k跑了含有水,NO3-和NH4+的AIMD轨迹,然后转成gro格式的轨迹。想用gromacs来创建索引文件然后进行分析。可是体系所有分子的残基名都是MOL,并且只能识别出H,O,N这三种元素,无法区分是这些元素属于哪个分子的。我想单独给水分子,NO3-和NH4+创建索引文件,请问选择语句应该怎么写呢?谢谢各位老师了!

作者
Author:
sobereva    时间: 2021-12-26 14:47
取决于当前gro文件里的内容
如果残基号不同,可以加上残基号来区分
如果残基名不同,可以加上残基名来区分
没有以上信息也可以自己加上




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