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标题: 24条多肽链的分子动力学模拟，在运行NPT步骤时，出现以下报错，麻烦老师们看看，非... [打印本页]

作者
Author: CMMCMM 时间: 2021-12-27 15:32
标题: 24条多肽链的分子动力学模拟，在运行NPT步骤时，出现以下报错，麻烦老师们看看，非...
是什么原因会出现这种报错呢？还望老师们解答一下

作者
Author: chenbq18 时间: 2021-12-27 15:56
初始结构不合理或者可以看看mdp参数设置

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2021-12-27 16:10
先用-ntmpi 1跑，体系太不均匀不好做域分解

作者
Author: sobereva 时间: 2021-12-27 16:32
-ntmpi 1跑一阵，等体系大致平衡了，再切换回默认的或者效率最佳的并行方式继续跑

作者
Author: CMMCMM 时间: 2021-12-28 14:47

chenbq18 发表于 2021-12-27 15:56
初始结构不合理或者可以看看mdp参数设置

好的，已经解决啦，非常感谢

作者
Author: CMMCMM 时间: 2021-12-28 14:48

喵星大佬发表于 2021-12-27 16:10
先用-ntmpi 1跑，体系太不均匀不好做域分解

好的，已经解决啦，非常感谢

作者
Author: CMMCMM 时间: 2021-12-28 14:48

sobereva 发表于 2021-12-27 16:32
-ntmpi 1跑一阵，等体系大致平衡了，再切换回默认的或者效率最佳的并行方式继续跑

好的，已经解决啦，非常感谢

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