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标题: 关于KiSTheIP中求反应速率常数时反应路径简并度σ的计算问题 [打印本页]

作者
Author: shiguang 时间: 2021-12-27 18:19
标题: 关于KiSTheIP中求反应速率常数时反应路径简并度σ的计算问题
最近在学习使用KiSTheIP计算反应的反应速率常数以及拟合的阿仑尼乌斯公式，在拜读了sob老师的帖子使用KiSThelP结合Gaussian基于过渡态理论计算反应速率常数(http://sobereva.com/246)之后，对于计算反应路径简并度σ有一定的疑惑。
在帖子中，sob老师写的是
“σ=σ(R)*n(R)/ [σ(TS)*n(TS)]
这里σ(R)和σ(TS)指的是反应物和过渡态结构的转动对称数，n(R)和n(TS)指的是反应物和过渡态结构的手性异构体数目” (, 下载次数 Times of downloads: 16)
而在 Theor Chem Account (2007) 118:813–826 原文page818中，提到由于过渡态的结构具有手性
(, 下载次数 Times of downloads: 23) (, 下载次数 Times of downloads: 7)

而两个过渡态到产物的速率常数相等，所以kf=2ke1

而当反应物有手性时，其中只有j2构象能够生成产物时
(, 下载次数 Times of downloads: 8) (, 下载次数 Times of downloads: 6)

由于反应物的手性，在分母中乘以了2
所以
这个地方σ的计算并不应该是简单的为“σ=σ(R)*n(R)/ [σ(TS)*n(TS)]”

不知各位老师怎么认为？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-12-27 20:42
式子是σ=σ(R)*n(TS)/ [σ(TS)*n(R)]，那篇老博文里有笔误

作者
Author: shiguang 时间: 2021-12-27 21:26

sobereva 发表于 2021-12-27 20:42
式子是σ=σ(R)*n(TS)/ [σ(TS)*n(R)]，那篇老博文里有笔误

好的，谢谢sob老师！

作者
Author: chenlei 时间: 2023-3-3 18:56
这边文章不好找呀（Theor Chem Account (2007) 118:813–826），可能我找文献的能力太差了，能发链接给我吗

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-3-4 05:05

chenlei 发表于 2023-3-3 11:56
这边文章不好找呀（Theor Chem Account (2007) 118:813–826），可能我找文献的能力太差了，能发链接给我吗 ...

能上谷歌的话，把文献引用信息粘贴到谷歌学术的搜索框里，一搜即可
不能上谷歌的话，用百度搜x-mol的主页，把文献引用信息粘到x-mol的搜索框里。但成功率比谷歌学术低
如果还不行，用web of science搜，用法自己百度
如果你们学校没买web of science，用百度搜Theor Chem Account的主页，在页面里找高级搜索的选项，把后面的年份、期号、页码复制进去搜

作者
Author: shiguang 时间: 2023-3-9 14:39

chenlei 发表于 2023-3-3 18:56
这边文章不好找呀（Theor Chem Account (2007) 118:813–826），可能我找文献的能力太差了，能发链接给我吗 ...

https://doi.org/10.1007/s00214-007-0328-0
用x-mol一搜就能搜到

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