计算化学公社

标题: 求助如何在PE晶胞内插入小分子 [打印本页]

作者
Author: 风起于夏 时间: 2022-1-3 16:32
标题: 求助如何在PE晶胞内插入小分子
各位前辈，我是想用GROMACS做氢穿透高密度聚乙烯，现在想求氢气在聚乙烯中的扩散系数和溶解度。本人是个小白，所以现在不知道怎么将氢气插入到聚乙烯晶胞内，想求助一下各位前辈有没有什么方法。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-1-3 22:01
可以把盒子设大，较高温度跑MD，体系中应该会有不少空隙，然后用gmx insert-molecules把H2插到空隙里

作者
Author: 风起于夏 时间: 2022-1-4 10:36

sobereva 发表于 2022-1-3 22:01
可以把盒子设大，较高温度跑MD，体系中应该会有不少空隙，然后用gmx insert-molecules把H2插到空隙里

好的，感谢sob老师的回复。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)