计算化学公社

标题: 布居分析相关问题 [打印本页]

作者
Author: dxyan 时间: 2016-2-23 16:57
标题: 布居分析相关问题
从小木虫追到这，是个量化小白，恳请赐教。
1.Gaussview中NBO输入中选择full NBO，就等同于关键词pop=NBO,进行NBO轨道分析计算，看到网上有些例子中加入POP=full这个关键词，查了一下这个关键词是指输出全部轨道分析，想请教下POP=full和pop=NBO算出来的有什么不同，在算pop=NBO时加上POP=full有什么用吗？
2. 检查点文件保存的时候有4个选项：不保存，savenbo, saveNLMO, savemixed，这样得到的输出文件有什么不同，一般做NBO分析常保存那一种？查了一下NLMO是指自然局域化轨道，不理解和NBO有什么不同。
概念比较混乱，也不是很懂，表拍

作者
Author: sobereva 时间: 2016-2-23 17:02
pop=full仅仅是把所有分子轨道(MO)的系数打印出来，和你目前谈到的NBO分析没有任何关系。
pop=NBO是做NBO分析，建议先看http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=102里面的入门资料了解些NBO分析的基础。弄清楚NBO分析框架中的NAO、NHO、NBO、NLMO都是什么，以及NBO/NLMO与MO在特点上的区别。

默认情况下是把MO保存到chk文件里。pop=savenbo是把NBO分析得到的NBO轨道保存到chk里，saveNLMO就是保存NLMO，savemixed一般不用。应当先弄清楚你的目的何在，如果目的是观看NBO轨道图形，看此文的说明
使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道
http://sobereva.com/134

作者
Author: dxyan 时间: 2016-2-23 20:20
非常感谢大神，在思想家公社看到你的一些文章，感觉很多东西都比以前明白的。我是学化工的，但是有时也需要用量化的东西来解释实验现象，所以看很多东西似懂非懂的。打算多看下你推荐的资料，一天天进步。

作者
Author: dxyan 时间: 2016-2-23 20:44
本帖最后由 dxyan 于 2016-2-23 21:35 编辑

sobereva 发表于 2016-2-23 17:02
pop=full仅仅是把所有分子轨道(MO)的系数打印出来，和你目前谈到的NBO分析没有任何关系。
pop=NBO是做NBO ...

1. 此外，还有些问题不太明白。按您所说pop=full是算出所有的分子轨道（MO），POP=nbo算的是自然键轨道，默认情况下是把MO保存到chk文件里，pop=savenbo是把NBO分析得到的NBO轨道保存到chk里，两者存入chk文件的目的主要是为了图形可视化吧？我目前只想通过NBO分析算相互NPA电荷布局，再一个想通过两分子复合物的NBO分析得到轨道键的二阶稳定化能来判断相互作用力。基于我这个目的是不是只要输入POP=nbo，保存就选don't save就行了吧？因为不需要做轨道图形，只想从输出文件中得到二阶稳定化能。
2. 我看到网上有些文件，POP=nbo和pop=full同时使用，这样做是为什么呢？3.另外我看到有别人算NBO，也就是算点单能的时候，进场会加上scf=tight。我一般都是在优化和频率做好后的分子结构上再算单点能+NBO的，不明白这个时候加scf=tight的目的是什么？
非常感谢您耐心回答。

作者
Author: sobereva 时间: 2016-2-23 21:28

dxyan 发表于 2016-2-23 20:44
1. 此外，还有些问题不太明白。按您所说pop=full是算出所有的分子轨道（MO），POP=nbo算的是自然键轨道， ...

1 不管你写不写pop=full，MO都是肯定要算出来的，只不过pop=full把详细信息（展开系数）输出出来，默认不输出是因为太占地方。
轨道存入chk一方面是作为可视化，另一方面可以作为之后计算用的初猜轨道。
对于你的目的pop=NBO就够了。

2 不要盲目效仿别人的输入文件。自己需要干什么就用什么关键词。

作者
Author: dxyan 时间: 2016-2-23 21:43

sobereva 发表于 2016-2-23 21:28
1 不管你写不写pop=full，MO都是肯定要算出来的，只不过pop=full把详细信息（展开系数）输出出来，默认 ...

谢谢soberevade 回复，到你这总能得到非常确实的回复

PS：签名档很赞

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