计算化学公社

标题: pdb2gmx生成的gro文件中蛋白质键发生断裂 [打印本页]

作者
Author: 何庆 时间: 2022-1-6 16:59
标题: pdb2gmx生成的gro文件中蛋白质键发生断裂
(, 下载次数 Times of downloads: 13)
用的是 Amber99SB-ILDN力场和TIP3P水，得到的protein.gro文件中蛋白质发生断裂
命令是 gmx pdb2gmx -f protein.pdb -o protein.gro -p topol.top -ignh
(, 下载次数 Times of downloads: 0)
(, 下载次数 Times of downloads: 0)

作者
Author: panernie 时间: 2022-1-7 11:51
显然不是断裂，全部都显示cpk类型进行查看。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)