计算化学公社

标题: 配置一台电脑，主要用于gromacs和comsol模拟，大家给点建议 [打印本页]

作者
Author: LWF 时间: 2022-1-6 20:03
标题: 配置一台电脑，主要用于gromacs和comsol模拟，大家给点建议
本帖最后由 LWF 于 2022-1-6 21:35 编辑

这是我们课题组内拟定的配置，主要用于分子动力学，期望各位老师帮忙给点意见

作者
Author: sylar 时间: 2022-1-6 20:08
GPU上30系列吧，能快不少

作者
Author: LWF 时间: 2022-1-6 20:12

sylar 发表于 2022-1-6 20:08
GPU上30系列吧，能快不少

那就换成3070

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2022-1-7 00:49
跑gmx的话，内存应该多几个通道，理想状态是2x6通道插满，根据预算决定，反正一根肯定不行。
预算充足，应该充分利用2个CPU的能力，再加一块同型号GPU。
实际跑MD时不能用2颗CPU带1块GPU，速度还不如1颗CPU（PCIe通道对应正确的前提下）。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-1-7 03:57
仔细看下文了解基本相关常识，并且参考里面的GPU加速推荐配置
计算化学购机配置推荐
http://sobereva.com/444

1080不仅性能弱，而且只能买到二手的

作者
Author: LWF 时间: 2022-1-9 15:33

Entropy.S.I 发表于 2022-1-7 00:49
跑gmx的话，内存应该多几个通道，理想状态是2x6通道插满，根据预算决定，反正一根肯定不行。
预算充足，应 ...

那就是在现有的基础上加至12根内存条和两块3070的显卡，这有点我们的预算了。10根内存条可以加，但是这个显卡就有点难，这个两块GPU和一块GPU的计算速度差距很大嘛，我们的体系一般在10万以内，100ns以内。

作者
Author: LWF 时间: 2022-1-9 15:34

sobereva 发表于 2022-1-7 03:57
仔细看下文了解基本相关常识，并且参考里面的GPU加速推荐配置
计算化学购机配置推荐
http://sobereva.com ...

我们现在换成了一块索泰的3070

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2022-1-9 15:57
本帖最后由 Entropy.S.I 于 2022-1-9 16:01 编辑

LWF 发表于 2022-1-9 15:33
那就是在现有的基础上加至12根内存条和两块3070的显卡，这有点我们的预算了。10根内存条可以加，但是这个 ...

12根16GB 2666和10根16GB 2666就差800元。12根8GB都够了。TB上买寨条/二手条还能便宜一半，稳定性没差

MD专用机，双路CPU应该配2块GPU，只装1块GPU是浪费CPU。
如果没有2块GPU的预算，用单路平台就行了。

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2022-1-9 16:12
不知道你们gmx和comsol一起用是做什么研究，如果comsol用得很频繁，那么双路平台配1块GPU也无妨，内存还是用12*16GB
只是需要注意绑定CPU

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)