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标题: 求问能从Gaussian计算得到的IRC直接提取反应能垒和隧穿宽度信息吗? [打印本页]

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mxr21    时间: 2022-1-7 21:22
标题: 求问能从Gaussian计算得到的IRC直接提取反应能垒和隧穿宽度信息吗?
(1)通过Gaussian计算,其中maxpoints=50,stepsize=20得到了IRC曲线,两端平缓,可以直接读取点的坐标计算反应能垒(过渡态纵坐标-反应物纵坐标),隧穿宽度(生成物横坐标-反应物横坐标)吗?(2)如果可以那么反应物和生成物该怎么寻找(看到公社中帖子提到对IRC端点进行极小值能量优化,但是这样优化出来了就找不到对应的横坐标了,无法计算隧穿宽度)



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snljty    时间: 2022-1-7 23:11
本帖最后由 snljty 于 2022-1-8 08:26 编辑

能垒不能。再平缓也没收敛到极小值,差距往往还很明显。另一方面,通常应该对过渡态和底物产物更高级别计算的高精度单点能,与优化和频率分析的相对较低级别的自由能校正项相加。
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sobereva    时间: 2022-1-8 06:24
如果两端已经基本跑平了,跑出来的IRC部分就已经足够定义隧穿宽度了
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mxr21    时间: 2022-1-8 10:16
sobereva 发表于 2022-1-8 06:24
如果两端已经基本跑平了,跑出来的IRC部分就已经足够定义隧穿宽度了

Bell35模型可以用来描述深度隧穿,在文献中,计算虚频的公式如下,其中m定义为发生隧穿的原子的质量(H的质量),但是通过量纲计算,我发现m的单位为(kn*mol),请问这种情况下如何对m取值呢?
计算过程:
根据量纲相等准则:量纲(RT)=量纲(h/2pi*v*)——J/mol=J*s*v——v=1/mol*s——m=kg*mol
(通过其它文献给出的临界温度Tc和虚频,反推得到m应该在10——19量级)





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