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标题: 药物分子有金属钌利用autodock进行分子对接报错 [打印本页]

作者
Author: weixue 时间: 2022-1-12 09:16
标题: 药物分子有金属钌利用autodock进行分子对接报错
大家好！最近在学习用autodock进行分子对接，我的药物分子是有金属钌（Ru）并且整体显两个单位正电荷，请问能实现和蛋白质的对接吗？因为我进行的时候跑到有一步报错说不能使用Ru原子

作者
Author: tomwong4253 时间: 2022-1-18 10:49
autodock适用面很窄的，别说过渡金属钌了，连铁铜这种常见的金属离子都没有合适的参数去描述，建议按照氨基酸侧链的性质试几个位置做QM计算。别的帖子有过类似的问题http://bbs.keinsci.com/thread-5222-1-1.html，里边的回复供参考。

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