计算化学公社

标题: 求助MOF（COF）孔道结构图绘制 [打印本页]

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Author: IamHK 时间: 2022-1-14 10:49
标题: 求助MOF（COF）孔道结构图绘制
各位老师好，目前想绘制一COF结构的孔道结构图，需要清晰表示出孔道内部大小得变化。查阅文献，见到下面图片
(, 下载次数 Times of downloads: 13)
请问老师，这种图可以用什么方法，软件制作？谢谢。

作者
Author: ABetaCarw 时间: 2022-1-14 11:02
看着感觉就是把COF拿过来做了一下自由体积图

作者
Author: IamHK 时间: 2022-1-14 11:18

ABetaCarw 发表于 2022-1-14 11:02
看着感觉就是把COF拿过来做了一下自由体积图

卢老师有帖子怎么做自由体积，就是不清楚怎么像他这个图一样沿着不同位置切开，展示孔洞内部细节。

作者
Author: tjuptz 时间: 2022-1-14 21:35

IamHK 发表于 2022-1-14 11:18
卢老师有帖子怎么做自由体积，就是不清楚怎么像他这个图一样沿着不同位置切开，展示孔洞内部细节。

导出cube文件到VMD里切开看

作者
Author: sobereva 时间: 2022-1-15 06:54
看此文
使用Multiwfn计算晶体结构中自由区域的体积、图形化展现自由区域
http://sobereva.com/617（http://bbs.keinsci.com/thread-25241-1-1.html）

按上文在VMD里画出来孔洞区域后，在VMD程序里可以用Visualization - Clipping plane tool对视角进行任意切割

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