计算化学公社

标题: 如何批量输出特定视角的结构图（png格式）？ [打印本页]

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作者
Author: Tanmin    时间: 2022-1-29 17:50
标题: 如何批量输出特定视角的结构图（png格式）？
大家好：
目前采用VASP计算了一些吸附结构，前期一直是采用VESTA输出侧视图与俯视图（png格式）。想通过批量方法减少此类重复性操作，所以请教大家：

• VESTA能否通过指令直接调用，以png或者其他图片格式输出对应视角的结构；（查阅了VESTA手册，并未找到类似说明）
• 如果VESTA不行，能够推荐一两款其他软件？
  

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作者
Author: sobereva    时间: 2022-1-29 21:13
VMD结合自写的批处理脚本可以

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作者
Author: Tanmin    时间: 2022-1-30 14:44

sobereva 发表于 2022-1-29 21:13
VMD结合自写的批处理脚本可以

谢谢社长 :)

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作者
Author: 万里云    时间: 2022-1-30 22:51
用ASE：

1. from ase.io import read, write
   
2. 
   
3. atoms = read("POSCAR", index=-1)
   
4. atoms.rotate(90, "x")
   
5. write("rotated.png", atoms)

复制代码

这段程序把原子绕x轴按照右手定则正向旋转90°，并输出到rotated.png。

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作者
Author: Tanmin    时间: 2022-2-2 15:16

万里云 发表于 2022-1-30 22:51
用ASE：
这段程序把原子绕x轴按照右手定则正向旋转90°，并输出到rotated.png。

谢谢，我研究研究！

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