计算化学公社

标题: 如何将盆分析生成的数个盆作为一个格点文件输出 [打印本页]

作者
Author:
lonicera    时间: 2022-1-31 23:53
标题: 如何将盆分析生成的数个盆作为一个格点文件输出
请问如何在Multiwfn中将生成的多个盆作为一个格点文件输出, 输出时可以设置只输出rho>0.001(或其他电子密度)的区域, 并且可以在vmd中通过不同Isovalue或者vol不同来区分不同的盆? 就是想实现类似于盆分析中选择-5, 后选a, 然后可以再设置只输出 rho>xxx 区域?

作者
Author:
sobereva    时间: 2022-2-2 01:12
你想要这种效果?
使用Multiwfn和VMD绘制原子盆(AIM盆)
https://www.bilibili.com/video/av85202089
作者
Author:
lonicera    时间: 2022-2-2 11:01
嗯, 对的. 我想如果可以在一个格点文件里输出的话, 可以比较方便地用vmd脚本批量导入并进行操作
作者
Author:
sobereva    时间: 2022-2-5 04:58
lonicera 发表于 2022-2-2 11:01
嗯, 对的. 我想如果可以在一个格点文件里输出的话, 可以比较方便地用vmd脚本批量导入并进行操作

即便是不同格点文件通过脚本批量导入也没任何费劲的地方,写个循环就完了,有什么载入什么




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3