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标题: 计算NMR光谱问题求助 [打印本页]

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Lym    时间: 2022-2-2 13:01
标题: 计算NMR光谱问题求助
各位老师好
我在拜读了sob老师关于使用Multiwfn计算NMR相关帖子之后,在计算的过程中遇到了如下问题(希望各位老师能够解答,谢谢老师)
以下计算是使用标度法进行计算1H,13C,(B3LYP/6-31G*,SMD隐形溶剂模型,在氯仿下溶剂中)
实验给出的数据:
1H NMR (400 MHz, CDCl3-d1, ppm): δ 13.00 (s, 1H), 10.47 (s, 1H), 8.02 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.93-7.89 (m, 2H), 7.68 (d, J = 1.6 Hz, 1H), 7.55-7.51 (m, 1H), 7.46-7.42 (m, 1H), 2.39 (s, 3H);
13C NMR (100 MHz, CDCl3-d1, ppm): δ 190.7, 158.5, 151.5, 135.0, 133.1, 132.5, 128.9, 126.8, 125.8, 123.7, 122.3, 121.5, 118.6, 20.3
但是我通过计算,
1H NMR: 7.796, 7.488,7.857, 7.547, 2.366, 11.650, 10.452 相比与实验值给出的8个值,计算值计算出来仅有7个值
13C NMR: 138.711, 149.727, 121.401, 126.669, 125.421, 121.001, 175.928 然而计算C的时候实验值总共是14个值,计算值却算出了15个值
根据上面的情况,是不是对于现在的情况中,标度法不适合当前的情况?(在这个过程中,因为有甲基的存在,因此已经考虑进去磁屏蔽值取平均)
希望能得到老师的解答,谢谢老师(且新年快乐!)



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wzkchem5    时间: 2022-2-2 15:18
给出分子式以及实验指认结果,光这么抽象地看数据看不出什么来
标度法最差只会把化学位移算错,绝不会把峰的个数算错(除非实验上两个峰偶然出现在同一处,被你指认成一个峰了),如果峰的个数和实验不符一定是更加基础的问题,比如活泼氢的考虑方式不对,有的等价核没有平均,等等
作者
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Lym    时间: 2022-2-2 16:03
本帖最后由 Lym 于 2022-2-3 10:09 编辑
wzkchem5 发表于 2022-2-2 15:18
给出分子式以及实验指认结果,光这么抽象地看数据看不出什么来
标度法最差只会把化学位移算错,绝不会把峰 ...

嗯嗯,老师关于等级核这个问题,这个分子式中含有甲基,这块我已经将原子平均考虑进去了,并且考虑之后的数值确实和实验值贴近了。
但是个数仍然和实验上的不对应。
实验上给出的数据图:(1H)

理论计算的图:

老师我重新把结构图补充上去了,您再帮我看一下,谢谢您



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sobereva    时间: 2022-2-2 16:46
应当把你的体系的立体结构图给出,把原子序号标出来,别人才能看出Multiwfn给的NMR谱上各个序号都对应什么
你的NMR图上chemical和degeneracy都拼错了

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Lym    时间: 2022-2-2 17:02
sobereva 发表于 2022-2-2 16:46
应当把你的体系的立体结构图给出,把原子序号标出来,别人才能看出Multiwfn给的NMR谱上各个序号都对应什么
...

谢谢老师提醒,我已经把chemical 和degeneracy改正了。
以及立体图和相应的序号放上去了
作者
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wzkchem5    时间: 2022-2-2 17:17
Lym 发表于 2022-2-2 09:03
嗯嗯,老师关于等级核这个问题,这个分子式中含有甲基,这块我已经将原子平均考虑进去了,并且考虑之后的 ...

哦我明白了,你不是直接读的计算出来的化学位移,而是作成图以后再从图上读峰值。这种情况下有可能导致峰的个数不一样的原因是,有两个峰实验上化学位移差得很多,但是计算上因为计算误差偶然导致两个峰合为一个峰。这个是正常的,解决方法是不要作出理论计算的图再读峰值,而是直接用文本编辑器打开输出文件,报那个里面给的化学位移(当然如果出现需要平均的情况,需要手动平均一下)。
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sobereva    时间: 2022-2-3 07:55
不要光去看图中的简并峰的数目。
比如H11和H20,从结构图上明显可见是化学不等价的两个氢,只不过由于算出来的化学位移太相近,小于Multiwfn判断简并性的阈值,所以绘图时候归到一起去了。但很可能其它计算模型下,二者差异就没这么小,就成了独立的两个峰了。
作者
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Lym    时间: 2022-2-3 10:12
sobereva 发表于 2022-2-3 07:55
不要光去看图中的简并峰的数目。
比如H11和H20,从结构图上明显可见是化学不等价的两个氢,只不过由于算出 ...

老师那我可以通过Multiwfn的设置可以将其分开嘛?还是在文章中说明原因就可以了呢?
作者
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wzkchem5    时间: 2022-2-3 15:53
本帖最后由 wzkchem5 于 2022-2-3 16:27 编辑
Lym 发表于 2022-2-3 03:12
老师那我可以通过Multiwfn的设置可以将其分开嘛?还是在文章中说明原因就可以了呢?

说明原因就行了,或者不报理论预测的核磁图、只报计算的化学位移数字




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