计算化学公社

标题: 运行orca时报错 [打印本页]

作者
Author: 是aweia 时间: 2022-2-14 15:12
标题: 运行orca时报错
本帖最后由是aweia 于 2022-2-14 15:19 编辑

我在使用ORCA时，出现以下报错：
Checking for transition data:                ...done
Computing transition dipole derivatives       ...

            <<Displacing mode 1 (+)>>
            <<Displacing mode 1 (-)>>
            <<Displacing mode 2 (+)>>
            <<Displacing mode 2 (-)>>
            <<Displacing mode 3 (+)>>ing an OpenFabrics device.

Local host: c12r1n11
  Local device: mlx5_0
--------------------------------------------------------------------------
[c12r1n11:51041] 31 more processes have sent help message help-mpi-btl-openib.txt / error in device init
[c12r1n11:51041] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages
--------------------------------------------------------------------------
WARNING: There was an error initializing an OpenFabrics device.
我ORCA用的少，之前在计算S1和T1态的过程中都运行正常，后在计算ISC速率时出现以上报错。经过论坛大佬提醒并且查看了ORCAforum，该报错可能是OPENMPI的问题，但我反复安装了OPENMPI，并严格按照《量子化学程序ORCA的安装方法》量子化学程序ORCA的安装方法 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)一文进行操作，
在作业提交脚本中，我加入了OPENMPI的PATH和lib路径：

module purge
export PATH=~/bin/ORCA/orca_5_0_1_linux_x86-64_shared_openmpi411:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=~/bin/ORCA/orca_5_0_1_linux_x86-64_shared_openmpi411:$LD_LIBRARY_PATH
export PATH=~/bin/OPENMPI/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=~/bin/OPENMPI/lib:$LD_LIBRARY_PATH

   ~/bin/ORCA/orca_5_0_1_linux_x86-64_shared_openmpi411/orca *.inp >out

该报错无法消除，请教大家有没有好的解决办法，万分感谢

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-2-14 16:15
这个是ORCA 5.0.1的bug（参见https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=8&t=8451），解决方法是改用5.0.2，或者等几天5.0.3出来以后用5.0.3。
如果用5.0.2的话，需要注意避开另一个bug：https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=54&t=8493

作者
Author: ball2006 时间: 2022-2-14 16:46
增加export OMPI_MCA_btl_openib_allow_ib=1试试

作者
Author: 牧生 时间: 2022-2-14 17:13
本帖最后由牧生于 2022-2-14 17:15 编辑

wzkchem5 发表于 2022-2-14 16:15
这个是ORCA 5.0.1的bug（参见https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=8&t=8451），解决方法是改用5 ...

我的理解是，等几天，orca 5.0.3就要发布了

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-2-14 17:19

牧生发表于 2022-2-14 10:13
我的理解是，等几天，orca 5.0.3就要发布了

对，应该就这两周

作者
Author: 牧生 时间: 2022-2-14 17:27

wzkchem5 发表于 2022-2-14 17:19
对，应该就这两周

期待orca能尽快支持IRC等功能，毕竟我们单位应该是不会花钱买gaussian的。

作者
Author: zjxitcc 时间: 2022-2-14 17:49

牧生发表于 2022-2-14 17:27
期待orca能尽快支持IRC等功能，毕竟我们单位应该是不会花钱买gaussian的。

让我想起论坛上有个帖子说他们课题组一定要花钱买第一性原理软件，向其推荐CP2K、QE全都不要，钱多劝都劝不住。。。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-2-14 18:09

牧生发表于 2022-2-14 10:27
期待orca能尽快支持IRC等功能，毕竟我们单位应该是不会花钱买gaussian的。

IRC本来就支持啊，5.0.0开始就支持了

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-2-14 18:15

zjxitcc 发表于 2022-2-14 10:49
让我想起论坛上有个帖子说他们课题组一定要花钱买第一性原理软件，向其推荐CP2K、QE全都不要，钱多劝都劝 ...

这个还好，可以解释成是基金快结题了想把钱尽量花完。我最想不通的是宁可用盗版高斯也不用正版orca的。要是用的是只有高斯支持而orca不支持的功能（屈指可数）也就算了，但是实际上只是想做个opt freq。。。
所以一般在高斯和orca表现差不多的场合我倒不会劝人用orca，但是如果碰到求盗版高斯的，我一定要叫ta用orca，毕竟高斯官方也不希望大家用盗版高斯，我尽管是orca团队的，在这个问题上也没有利益相关。

作者
Author: 牧生 时间: 2022-2-14 19:09
本帖最后由牧生于 2022-2-14 20:28 编辑

http://bbs.keinsci.com/thread-10141-1-1.html

是我疏忽了，没跟上形势发展。这个帖子是一年多以前的了，orca版本较低，所以不支持。

待我去翻翻手册，如何用orca做irc
http://bbs.keinsci.com/thread-11625-2-1.html 18楼里，社长讲了，ORCA的IRC功能还比较差，不知道现在IRC功能和gaussian比起来如何

作者
Author: abin 时间: 2022-2-14 19:49
用户有选择的自由。

比如，用户就要搞一个M06 +Opt + Freq + TDA，
需要激发态梯度，
ORCA估计玩起来比较麻烦。

也许，就是五公里的距离，
但就是有钱任性，喜欢开全自动挡的保时捷。
你非要跑过去，给人安利，
手动挡的，各种好改装的红标Honda才是正经。
自动挡没有赛车精髓……
这一定会被富婆嗤之以鼻的……

各有所好，不必强求。

你要说高斯很贵吧？
不见的。估计开发者，是根据自己的运营和投入成本，
团队福利，结合同行经济能力做的定价。

美国人定价，为什么一定要照顾其他国家经济水平？
如果分区定价，
专业软件本身又不是快销品，
也不方便做类似主机游戏一样的锁区版权限定。
一位做低价格，是不可能的。
太低价格的话，
开发者还活不活了，还做不做开发了？

个人言论，仅仅表述字面意思。

作者
Author: mfdsrax2 时间: 2022-2-14 21:02
ORCA的IRC可以调整阈值，某些方面比GAUSSIAN好用一点

作者
Author: popeyezheung 时间: 2024-9-14 20:37
https://www.open-mpi.org/faq/?ca ... cs#ofa-device-error

53. I'm getting errors about "initializing an OpenFabrics device" when running v4.0.0 with UCX support enabled. What should I do?

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