计算化学公社

标题: 水合离子结合能计算求助 [打印本页]

作者
Author: qlyfe 时间: 2022-2-15 09:52
标题: 水合离子结合能计算求助
老师们好，我这边计算了1个铁离子和5个水分子还有1个DMSO结合的模型，想问一下这种情况下计算结合能的两个问题
1 计算离子和溶剂总的结合能时应该使用E(tot)-E(Fe2+)-E(other)还是E(tot)-E(Fe2+)-5*E(H2O)-E(DMSO)呢？
2 在这种情况下如果想单独计算铁离子和DMSO之间的相互作用能，应该怎么做呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-2-16 10:41
1 水溶液中Fe本身和6个水配位。如果只是考察DMSO与水溶液中水合铁离子的结合过程，应当计算DMSO配位后把一个H2O替换出去的能量差。

2 你先想清楚这么做有什么实际意义，以及实际到底想要研究什么，搞清楚实际中物质的存在状态

作者
Author: qlyfe 时间: 2022-2-16 14:52

sobereva 发表于 2022-2-16 10:41
1 水溶液中Fe本身和6个水配位。如果只是考察DMSO与水溶液中水合铁离子的结合过程，应当计算DMSO配位后把一 ...

老师好，我是想考虑往铁离子水溶液中加入另一种溶剂时，这种溶剂分子取代水分子与铁离子配位以后，铁离子与溶剂分子间结合能的变化。我这边计算了6个水分子的，以及其中一个水分子被一个dmso或者环丁砜取代以后的情况，想比较取代以后溶剂分子与铁离子结合强弱。之前说的第二个问题就是想问如何能知道如果总的溶剂分子和铁离子结合变强了，是因为dmso本身与铁离子结合更强导致总的结合能变大，还是由于另外溶剂的引入使得水分子和铁离子结合变强而使总的结合能变大呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-2-17 09:01

qlyfe 发表于 2022-2-16 14:52
老师好，我是想考虑往铁离子水溶液中加入另一种溶剂时，这种溶剂分子取代水分子与铁离子配位以后，铁离子 ...

1 对这种目的实际上就是算配体交换的自由能变

2 算一下带六个水的铁离子掉下去一个水的配体解离能，以及带5个水1个其它配体的铁离子掉下去这个其它配体的解离能

至于一个水被一个其它配体替换后Fe和原先配位水的结合强度是否有变化，可以用Multiwfn算Mayer键级、做AIM分析讨论BCP性质等方式考察
Multiwfn支持的分析化学键的方法一览
http://sobereva.com/471（http://bbs.keinsci.com/thread-12488-1-1.html）

作者
Author: qlyfe 时间: 2022-2-17 10:28

sobereva 发表于 2022-2-17 09:01
1 对这种目的实际上就是算配体交换的自由能变

2 算一下带六个水的铁离子掉下去一个水的配体解离能，以 ...

明白了，谢谢老师！

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