计算化学公社

标题: gromacs计算氨基酸的rmsf时有必要去掉H原子吗？ [打印本页]

作者
Author: xuxu 时间: 2022-2-17 07:50
标题: gromacs计算氨基酸的rmsf时有必要去掉H原子吗？
请问下大家，gromacs计算氨基酸的rmsf时有必要去掉H原子吗？蟹蟹

作者
Author: sobereva 时间: 2022-2-17 09:16
干嘛要去掉？

作者
Author: xuxu 时间: 2022-2-17 10:35

sobereva 发表于 2022-2-17 09:16
干嘛要去掉？

我觉得H动的幅度比较大，所以在算rmsf的时候可以不考虑吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-2-17 12:57

xuxu 发表于 2022-2-17 10:35
我觉得H动的幅度比较大，所以在算rmsf的时候可以不考虑吗？

没必要刻意如此
H相对于重原子位置也不会有什么大幅度变化

作者
Author: xuxu 时间: 2022-2-17 19:24
好的，蟹蟹sob老师

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