计算化学公社

标题: 用Multiwfn显示有机分子的电荷密度求助 [打印本页]

作者
Author: BewhY 时间: 2022-2-17 17:32
标题: 用Multiwfn显示有机分子的电荷密度求助
对一个有机分子优化完之后，我用Multiwfn显示它的电子密度，得到的图如下，在图片界面没有图像。另一个分子用同样的方法却成功了，不知道问题出在哪里。
(, 下载次数 Times of downloads: 15) (, 下载次数 Times of downloads: 14)

作者
Author: sobereva 时间: 2022-2-17 19:42
作图平面选得不合理，看此文4.2节
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452

作者
Author: BewhY 时间: 2022-2-19 17:32

sobereva 发表于 2022-2-17 19:42
作图平面选得不合理，看此文4.2节
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452

非常感谢.改变输入的Y值就能把XZ平面显示出来了，又学到了一点

作者
Author: BewhY 时间: 2022-2-19 23:43

sobereva 发表于 2022-2-17 19:42
作图平面选得不合理，看此文4.2节
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452

(, 下载次数 Times of downloads: 12) 想请教一下：因为中间三个苯环是共平面的，所以以图示的三个原子定义的平面做电子密度图，成功了，但是左右边上非共面的两个苯环显示不全该怎么办？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-2-20 17:12

BewhY 发表于 2022-2-19 23:43
想请教一下：因为中间三个苯环是共平面的，所以以图示的三个原子定义的平面做电子密度图，成功了，但是左 ...

博文明确说了

Q69：绘制的平面图里面有些原子的标签没显示出来是怎么回事？
A：只有当某个原子与作图平面的垂直距离小于特定阈值时，这个原子在这个平面上的投影位置才会显示出原子标签（倘若没有这个阈值设置，所有原子标签都显示出来，对于大体系，图上的标签将何等混乱可想而知）。没显示出来标签的那些原子显然是因为其距离作图平面超过了默认阈值。阈值可以在后处理界面通过选项17 Set distance threshold for showing atom labels进行修改。阈值设定之后，你还可以选择是否把超过这个阈值的原子用比较细的字体显示出表现，以区别那些离作图平面比较近的原子。这个选项的默认值通过settings.ini里的disshowlabel参数控制。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)