计算化学公社

标题: gaff力场的gromacs格式的文件 [打印本页]

作者
Author:
Kangtor    时间: 2022-2-18 20:33
标题: gaff力场的gromacs格式的文件
前段时间写了一份gaff力场文件,可将其中内容copy到gromacs相应文件里。 不过没测试过对不对,慎重选择


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tjuptz    时间: 2022-2-19 18:16
请问楼主是从ambertool的参数里转换的吗
作者
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Kangtor    时间: 2022-2-19 19:31
tjuptz 发表于 2022-2-19 18:16
请问楼主是从ambertool的参数里转换的吗

amber的力场文件中改写过来的

作者
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tjuptz    时间: 2022-2-20 10:56
Kangtor 发表于 2022-2-19 19:31
amber的力场文件中改写过来的

谢谢分享
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白也    时间: 2022-9-17 17:36
本帖最后由 白也 于 2022-9-17 17:48 编辑

看了一下,里面关于bonded参数的kb值以及nonbonded里面的sigma值应该是都忘记乘2了,使用的需要注意




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