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标题: Tcl脚本与gmx hbond计算氢键结果差别较大 [打印本页]

作者
Author:
xryao    时间: 2022-2-19 18:43
标题: Tcl脚本与gmx hbond计算氢键结果差别较大
各位老师,在利用Tcl写脚本计算分子间氢键与直接使用gmx hbond计算得到氢键差别较大,明显Tcl脚本计算得到的氢键数量较少,麻烦大家看看是不是脚本有什么问题,谢谢。
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作者
Author:
sobereva    时间: 2022-2-19 19:50
gromacs默认键角判据对应VMD里键角判据43.1度
作者
Author:
xryao    时间: 2022-2-19 20:56
sobereva 发表于 2022-2-19 19:50
gromacs默认键角判据对应VMD里键角判据43.1度

好的,谢谢sob老师,我看您的脚本都是用的35度,所以就用的35度。




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