计算化学公社

标题: 关于计算大体系配合物的pKa求助 [打印本页]

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达斯维达尼亚    时间: 2022-2-22 20:34
标题: 关于计算大体系配合物的pKa求助
本帖最后由 达斯维达尼亚 于 2022-2-22 21:15 编辑

请教各位老师们,本人想依次计算带四个羧基的配合物的三个pKa(90个原子,含1个Fe,开壳层体系),在看了一些文献以及看了论坛上的一些问答之后,计划用B3LYP带溶剂模型SMD优化分子结构并进行振动分析,用DLPNO-CCSD(T)计算气相单点能,再用优化的结构算溶解自由能(M05-2X,6-31Gd),最后用得到的能量进行计算。我的问题有两个:
1、当优化A-结构时基组需要加弥散函数吗?还是说几个结构需要保持一致的计算级别?
2、经验判断DLPNO-CCSD(T)能算的动我的体系吗?看到论坛上的大佬说算得动100个原子,但是我进行了尝试,36核intel,算了一天多还没算完,还经常崩溃,如果说这个方法算不动的话,大家有没有推荐的其他较为准确的方法呢?
先拜谢各位大佬!




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sobereva    时间: 2022-2-22 21:12
1 用6-311G*,局部带大量负电荷的地方可以再带上弥散。

2 跟你的内存量和基组有关。“能不能算得动”这种事的答案对具体计算条件和计算资源极度敏感。不重要的地方可考虑用小基组节约时间和内存开销。
不要用“优化气相单点能”这种莫名其妙的表述
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达斯维达尼亚    时间: 2022-2-22 21:22
sobereva 发表于 2022-2-22 21:12
1 用6-311G*,局部带大量负电荷的地方可以再带上弥散。

2 跟你的内存量和基组有关。“能不能算得动”这 ...

1、好的谢谢社长!
2、我的计算机是36核128GB,orca的关键词是DLPNO-CCSD(T) normalPNO RIJK def2-TZVPP def2/JK def2-TZVPP/C

(语言习惯不好,已改)
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sobereva    时间: 2022-2-22 22:35
达斯维达尼亚 发表于 2022-2-22 21:22
1、好的谢谢社长!
2、我的计算机是36核128GB,orca的关键词是DLPNO-CCSD(T) normalPNO RIJK def2-TZVPP ...

DLPNO-CCSD(T)算大体系极耗内存,128GB的情况下并行的核数很有限,建议还是考虑双杂化泛函,结合QZ档次的基组算这个也不费劲
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达斯维达尼亚    时间: 2022-2-23 13:56
sobereva 发表于 2022-2-22 22:35
DLPNO-CCSD(T)算大体系极耗内存,128GB的情况下并行的核数很有限,建议还是考虑双杂化泛函,结合QZ档次的 ...

好的 谢谢社长的答复。




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