计算化学公社

标题: 求助：Gaussian安装问题 [打印本页]

作者
Author: sun877469558 时间: 2022-2-23 11:17
标题: 求助：Gaussian安装问题
按照sob老师教程安装linux g16后，按照计算“计算RESP原子电荷的超级懒人脚本（一行命令就算出结果）”去计算RESP电荷，但gau.out提示

Entering Gaussian System, Link 0=g16
Files in the Gaussian directory are world accessible.
This must be fixed.

通过查阅了解是权限问题，但是安装时候按照步骤输入了
chmod 750 -R *

然后觉得也许是自己忘记了，重新输入chmod 750 -R *，结果还是不行，请问各位老师应该如何解决？

作者
Author: abin 时间: 2022-2-23 13:44
按照Gaussian官方安装说明处理即可.
搞750操作, 某些时候会遇到麻烦.

作者
Author: sobereva 时间: 2022-2-23 18:14
你先用ls -l看看当前目录下的Gaussian的那些文件是否对应了750的权限，如果chmod设置没生效，可能你根本就没修改的权限，用root账户改

作者
Author: sun877469558 时间: 2022-2-25 22:57

sobereva 发表于 2022-2-23 18:14
你先用ls -l看看当前目录下的Gaussian的那些文件是否对应了750的权限，如果chmod设置没生效，可能你根本就 ...

谢谢社长回复，原因找到了，因为我是双系统，安装g16的磁盘是ntfs，然后执行chmod时，即使是root也改不动，后来磁盘分区为ext4就可以了，但是现在我还有一个问题就是。我的电脑CPU是AMD 5950X，我装了G16-A03-AVX2，之前不了解，用的时候出现Error: illegal instruction, illegal opcode，看您2015年一个帖子回复，很可能是CPU架构与版本不兼容，请问，我应该用g16的哪个版本呢，或者只能换机子？

作者
Author: casea 时间: 2022-2-25 23:16

sun877469558 发表于 2022-2-25 22:57
谢谢社长回复，原因找到了，因为我是双系统，安装g16的磁盘是ntfs，然后执行chmod时，即使是root也改不动 ...

5950X可以用avx2，社长gaussian安装教程有说明，http://sobereva.com/439

作者
Author: snljty 时间: 2022-2-25 23:37

sun877469558 发表于 2022-2-25 22:57
谢谢社长回复，原因找到了，因为我是双系统，安装g16的磁盘是ntfs，然后执行chmod时，即使是root也改不动 ...

export PGI_FASTMATH_CPU=sandybridge如果分区格式希望双系统都能读取，可以考虑exFAT

作者
Author: sun877469558 时间: 2022-2-26 13:11

snljty 发表于 2022-2-25 23:37
export PGI_FASTMATH_CPU=sandybridge如果分区格式希望双系统都能读取，可以考虑exFAT

感谢指导，按照您说的命令，已经解决问题

作者
Author: sun877469558 时间: 2022-2-26 13:11

casea 发表于 2022-2-25 23:16
5950X可以用avx2，社长gaussian安装教程有说明，http://sobereva.com/439

根据社长文章所述 http://sobereva.com/439
运行Gaussian前通过这行命令定义环境变量：export PGI_FASTMATH_CPU=sandybridge。
成功解决问题，谢谢

作者
Author: Roonry 时间: 2022-5-24 20:23
按照sob老师说的在虚拟机上安装gaussian09 但安装过程中出现问题请问这个怎么解决

作者
Author: snljty2 时间: 2022-5-24 20:37

Roonry 发表于 2022-5-24 20:23
按照sob老师说的在虚拟机上安装gaussian09 但安装过程中出现问题请问这个怎么解决

截图你的.bashrc。大概率是没设置g09root环境变量。

作者
Author: Roonry 时间: 2022-5-24 20:51

snljty2 发表于 2022-5-24 20:37
截图你的.bashrc。大概率是没设置g09root环境变量。

麻烦帮我看看有什么问题吗

作者
Author: snljty2 时间: 2022-5-24 21:07

Roonry 发表于 2022-5-24 20:51
麻烦帮我看看有什么问题吗

不能叫g09D01，最底下一层目录必须叫g09。或者说你的Gaussian安装目录必须是$g09root/g09。

作者
Author: qcn1211 时间: 2025-6-8 19:19
本帖最后由 qcn1211 于 2025-6-8 23:11 编辑

请问集群系统上out文件只有“Entering Gaussian System, Link 0=g16” 这一行字是出了什么问题？原来一直都正常

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