计算化学公社

标题: 求助，能进行长方形生物膜的模拟吗？ [打印本页]

作者
Author: lnz 时间: 2022-2-23 15:18
标题: 求助，能进行长方形生物膜的模拟吗？
我看到一般在生物膜体系中一般使用的都是正方形的膜。最近做的一个体系更关注一个方向上Lipid的运动，比如X方向，想看看能不能用长方形的膜来减少计算量。用的软件是gromacs，如果可以，想知道一下mdp的设置是哪些地方要改。提前感谢各位大佬的解答。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-2-23 18:16
恰当建模
控压用各项异性控压，X、Y、Z都分别控压

作者
Author: 园园乖 时间: 2022-2-24 15:01
可以，只是膜的xy方向的尺寸要控制好

作者
Author: lnz 时间: 2022-4-1 17:01

园园乖发表于 2022-2-24 15:01
可以，只是膜的xy方向的尺寸要控制好

想请教一下什么样的xy尺寸算是控制好了我自己去试了些跑不下去。感谢指点

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