计算化学公社

标题: 催化剂大概含有300个原子，想确定小分子在其上的反应路径，用什么软件比较合适？ [打印本页]

作者
Author: 南晓 时间: 2022-2-25 09:38
标题: 催化剂大概含有300个原子，想确定小分子在其上的反应路径，用什么软件比较合适？
求助我计算小分子在催化剂上的吸附，催化剂大概含有300个左右原子，想确定小分子在其上的反应路径，请问大家我该用什么软件比较合适

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2022-2-25 09:58
是不是周期性体系，是的话没必要用那么多原子吧

作者
Author: 南晓 时间: 2022-2-25 10:23

yaoyuan0711 发表于 2022-2-25 09:58
是不是周期性体系，是的话没必要用那么多原子吧

建立的模型是非周期性体系，原子数比较多，想问问大家在这个模型下用什么软件算反应路径比较合适

作者
Author: sobereva 时间: 2022-2-25 11:10
Gaussian或ORCA
大多数情况通过恰当简化体系总能令原子数明显少于300个

作者
Author: dnlx 时间: 2022-2-25 11:21
催化剂需要这么多原子，估计是多个小分子，而且考虑助剂的作用，所以模型既大又厚。比如氧化锌(0001)面上担载铜，再让吸附的一氧化碳和氢气逐步变成甲醇。

作者
Author: 南晓 时间: 2022-2-25 15:35

dnlx 发表于 2022-2-25 11:21
催化剂需要这么多原子，估计是多个小分子，而且考虑助剂的作用，所以模型既大又厚。比如氧化锌(0001)面上担 ...

请问可以考虑用什么软件做这种大体系

作者
Author: 南晓 时间: 2022-2-25 15:38

sobereva 发表于 2022-2-25 11:10
Gaussian或ORCA
大多数情况通过恰当简化体系总能令原子数明显少于300个

是做小分子在含有几百个原子的催化剂团簇上

作者
Author: dnlx 时间: 2022-2-25 20:48

南晓发表于 2022-2-25 15:35
请问可以考虑用什么软件做这种大体系

社长有用ORCA的例子
http://bbs.keinsci.com/thread-16532-1-1.html

如果是我做催化剂和助剂的模拟，不会一下跑到300个原子。会由小到大，借助Multiwfn研究助剂和金属界面有什么特殊的地方，推测合理的活性位，再确定团簇尺度的敏感性。

作者
Author: 南晓 时间: 2022-2-26 10:39

dnlx 发表于 2022-2-25 20:48
社长有用ORCA的例子
http://bbs.keinsci.com/thread-16532-1-1.html

好的感谢我去看看这个例子，还有一个问题想请教，我已经知道小分子在团簇模型上的吸附位点，然后目的是要考察金属硫化物团簇尺度的敏感性，团簇最多要做到几百个原子，但是我只知道其暴露的晶面，请问这个团簇的形状和它的边缘结构我应该怎么合理的去确定？请问有没有好的建议还请指教，感谢！

作者
Author: dnlx 时间: 2022-2-26 13:43

南晓发表于 2022-2-26 10:39
好的感谢我去看看这个例子，还有一个问题想请教，我已经知道小分子在团簇模型上的吸附位点，然后目的是要 ...

社长文章里面有非常多的细节，比如说，你的硫化物模型的边缘对应的是“如果是无机晶体，有用赝氢、capped ECP、用大量背景电荷表现更长程区域原子的静电势等做法”——这些我都不懂。

作者
Author: 南晓 时间: 2022-2-26 18:47

dnlx 发表于 2022-2-26 13:43
社长文章里面有非常多的细节，比如说，你的硫化物模型的边缘对应的是“如果是无机晶体，有用赝氢、capped ...

好的感谢，我去看看

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