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标题: 如何生成修饰黑磷的力场参数和拓扑文件？ [打印本页]

作者
Author: ChaosChiao 时间: 2022-2-25 15:28
标题: 如何生成修饰黑磷的力场参数和拓扑文件？
请教各位老师同学，之前想做一些黑磷的模拟，请教了sob老师之后，我是默认单质形态的黑磷电荷全部为0，直接使用了GAFF生成了相关的参数文件。最近想对黑磷做一些修饰，如缺陷和空洞，这样黑磷会带上氧原子，其电荷不能默认为0，同时也不能使用单元参数再拓展到周期性结构的做法。需要一次性的生成比较大结构体系的参数，整体原子数大概在300-400左右，为不规则的磷原子和氧原子，请问这种情况下，有什么方法可以生成其力场参数？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-2-25 19:19
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