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标题: 求助：VASP在计算磁性体系电子步特别慢 [打印本页]

作者
Author: 枝江向大头 时间: 2022-2-25 20:41
标题: 求助：VASP在计算磁性体系电子步特别慢
实验室的机器是AMD EPYC 7702 *2，128个实际核，256线程，编译VASP使用的是intel的高性能计算包。目前的状况是计算一个一百多个原子的磁性体系，每电子步时间要五六分钟左右，而用超算平台的话半分钟就可以自洽一次。并且在实验室的机器上使用的核数越多计算越缓慢，在调试了NCORE和KPAR后，只有在16线程跑是最快的，达到了4分钟一步，使用32或者64进程的话基本算不动。
目前想到的问题有这几点：
1、内存没插满，每个处理器是八通道但现在只查了4根64G内存。
2、AMD使用intel mkl时候指令集没有优化？
3、超线程是否有影响？今天把服务器超线程关了之后并没有速度明显改变。
4、MPI不同会有很大影响么，使用CASTEP并行时速度很快，VASP速度却非常慢。
大家有什么解决办法或者经验么？INCAR附在下面。

ISTART= 0
LWAVE = .TRUE.
LCHARG = .TRUE.
NCORE = 4
KPAR = 8

LREAL = Auto

ICHARG = 2
ISMEAR = 0
SIGMA = 0.01
ENCUT = 520
NELM = 100
EDIFF = 1E-6

LORBIT = 11
NEDOS = 6000
EMAX = 30
EMIN = -30

EDIFFG = -0.01
ISIF = 2
IBRION = 2
POTIM = 0.5
NSW = 500

ISPIN = 2
MAGMOM = 81*0 27*3 27*0

AMIX = 0.2
BMIX = 0.0001
AMIX_MAG = 0.8
BMIX_MAG = 0.0001

IALGO = 38

LMAXMIX = 4

K点是2 2 1

OUTCAR一部分如下：
POTLOK:  cpu time 8.6378: real time 8.6437
SETDIJ:  cpu time 0.3367: real time 0.3368
   EDDAV:  cpu time  333.4370: real time  333.6157
   DOS:  cpu time 0.0110: real time 0.0110
CHARGE:  cpu time 8.1318: real time 8.1364
MIXING:  cpu time 0.3944: real time 0.3946
--------------------------------------------
   LOOP:  cpu time  350.9487: real time  351.1383

运行命令是mpirun -np 16 vasp_ctl

作者
Author: 枝江向大头 时间: 2022-2-25 20:42
大家有什么想法都可以说一下，这种五六分钟一步实在是太难受了

作者
Author: 枝江向大头 时间: 2022-2-27 19:44
还有就是大家在计算的时候内存占用多少呢？我在16线程跑一个一百多个原子占用了90G内存，跑一个270个原子的体系就直接占用满了256G，这么大的占用正常么

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