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标题: IRI分析聚合物和药物的Π-Π作用问题 [打印本页]

作者
Author: JefferSon 时间: 2022-3-1 10:00
标题: IRI分析聚合物和药物的Π-Π作用问题
Sob老师，各位大神大家好，
我最近在探究聚合物和药物的Π-Π作用，根据sob老师的指导做了IRI分析。
体系是在wb97xd/6-311+g(d,p)并加了BSSE。
有如下几个问题，感谢大家的指导

。
（1）IRI分析我是应该用BSSE算的fchk，还是用没有BSSE的溶剂下算的fchk呢，实际上散点图和IRI图差别不大；
（2）在IRI分析后，苯环出出现绿色的等值面，那是否是说我的聚合物和药物其实没有Π-Π作用，而只是范德华作用，但散点图在0.3到0.4处有spike。
（3）IRI分析中的等值面有否可能是由于其他原子的影响，因此我只考虑了2个苯环，12个碳的作用，其散点图显示在0.3到0.4处有IRI图显示有几个spike，同时IRI图出现了蓝色区域，以此来说明体系中含有Π-Π作用是否可取呢？
谢谢Sob老师和各位的传道授业解惑，感谢！

作者
Author: snljty 时间: 2022-3-1 10:42
本帖最后由 snljty 于 2022-3-1 13:13 编辑

问题1，反正你要用的是整体在整体的基组下的波函数，这个和有没有BSSE校正无关。
你的问题2本身就是有问题的，参考https://doi.org/10.1002/anie.200705157，pi-pi相互作用本来就属于范德华相互作用。

作者
Author: JefferSon 时间: 2022-3-1 11:55
本帖最后由 JefferSon 于 2022-3-1 11:57 编辑

snljty 发表于 2022-3-1 10:42
你的问题2本身就是有问题的，参考https://doi.org/10.1002/anie.200705157，pi-pi相互作用本来就属于范德华 ...

应该是只存在普通范德华作用而没有pi-pi相互作用，感谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-2 03:46
这明摆着就是pi-pi作用。pi共轭片段间的绿色大面积等值面是pi-pi堆积典型特征
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别把无关概念瞎搅合到一起，当前问题和BSSE没有丝毫联系，更不要做counterpoise任务，纯粹瞎折腾。

作者
Author: JefferSon 时间: 2022-3-2 09:30

sobereva 发表于 2022-3-2 03:46
这明摆着就是pi-pi作用。pi共轭片段间的绿色大面积等值面是pi-pi堆积典型特征

谢谢sob老师

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