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标题: 使用Multiwfn和VMD画阴离子分子静电势图，确定抗衡离子位置时遇到的问题 [打印本页]

作者
Author: 吴双 时间: 2022-3-1 15:10
标题: 使用Multiwfn和VMD画阴离子分子静电势图，确定抗衡离子位置时遇到的问题
大家好，我用Multiwfn结合VMD画阴离子的分子静电势图，绘制的具体结构是P2W18O62-6(一种多金属氧酸盐结构，整体化合价是-6价),想通过画MEP图确定抗衡离子的位置，使得整体呈现电中性。具体操作http://sobereva.com/443（使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图）。但是在计算过程中遇到了一些问题，想请教一下各位老师。1.绘制阴离子的分子静电势图后，应该根据极小值里面最小的得六个数值标定抗衡离子的位置，还是要根据所有数值，在极大值和极小值里选择数值最小的六个数值?

2.分子静电势图里的极大值和极小值具体含义是什么？为什么有些极大值的数据要小于极小值的数据？
下图是我绘制的图形，以及surfanalysis.pdb文件信息。
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作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-2 03:53
1 找静电势最负的六个表面极值点

2 超级详细的Multiwfn手册里都写得明明白白

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