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标题: 含有小分子的聚合物在完成一次弛豫后在进行nvt报错 [打印本页]

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Author: 风起于夏 时间: 2022-3-1 19:18
标题: 含有小分子的聚合物在完成一次弛豫后在进行nvt报错
各位前辈，我对含有小分子的聚合物进行能量最小化，在进行弛豫后想在进行NVT后求均方位移曲线，但是这次NVT没有成功，报错如下图，想请教一下造成这种现象的原因是什么，怎么解决？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-2 03:07
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Author: 风起于夏 时间: 2022-3-2 08:37

sobereva 发表于 2022-3-2 03:07

老师，我还是不太清楚，我已经进行了NVT和NPT(这是不是说明初始结构和拓扑文件是合理的)，再次进行NVT显示了LINCS报错还可能是初始结构或者拓扑文件的原因吗

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Author: sobereva 时间: 2022-3-2 22:04

风起于夏发表于 2022-3-2 08:37
老师，我还是不太清楚，我已经进行了NVT和NPT(这是不是说明初始结构和拓扑文件是合理的)，再次进行NVT显 ...

我不知道你具体怎么跑的
继续进行NVT的时候要通过之前的cpt文件延续最后的坐标和速度

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Author: 风起于夏 时间: 2022-3-3 09:24

sobereva 发表于 2022-3-2 22:04
我不知道你具体怎么跑的
继续进行NVT的时候要通过之前的cpt文件延续最后的坐标和速度

好的老师

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