计算化学公社

标题: VMD找不到hirsh_rho.vmd路径问题 [打印本页]

作者
Author: sysu_chem 时间: 2022-3-2 01:03
标题: VMD找不到hirsh_rho.vmd路径问题
大家好，我刚接触VMD和Multiwfn软件，就遇到了一个问题。我按照B站视频操作学习绘制Hrishfeld surface图，但是VMD进行到：source hirsh_rho.vmd这一步时显示couldn't read file "hirsh_rho.vmd": no such file or directory. 请问有没有大神可以帮我解答一下吗？特别感谢。我也不知道是不是路径问题，不懂怎么弄了，谢谢大家。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-2 03:01
此文件不在当前目录下
当前目录是什么，在VMD文本窗口里输入dir便知

作者
Author: sysu_chem 时间: 2022-3-2 08:25
太感谢了，太激动了，终于知道了，感谢感谢！！！还有一个问题想打扰一下您，像MOF多孔材料吸附气体分子后，怎么用VMD或multiwfn来实现分子与骨架的作用力呢？如下图文献所示: (, 下载次数 Times of downloads: 29)

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-2 21:24

sysu_chem 发表于 2022-3-2 08:25
太感谢了，太激动了，终于知道了，感谢感谢！！！还有一个问题想打扰一下您，像MOF多孔材料吸附气体分子后 ...

这图是文章作者用Multiwfn+VMD做的IGM图

仔细看
通过独立梯度模型(IGM)考察分子间弱相互作用
http://sobereva.com/407（http://bbs.keinsci.com/thread-9472-1-1.html）
使用Multiwfn结合CP2K通过NCI和IGM方法图形化考察固体和表面的弱相互作用
http://sobereva.com/588（http://bbs.keinsci.com/thread-21742-1-1.html）

但如今不再推荐用IGM，用IGMH好得多得多，看http://bbs.keinsci.com/thread-26613-1-1.html，里面给了十分详细的教程，孤立体系和周期性都支持

作者
Author: SiC77 时间: 2023-11-21 09:54
您好！请问您是怎么解决的？我通过VMD想修改HOMOLUMO的配色，但是cub文件一直打不开总是出现这个。
软件重装了很多次。。dir搜索文件也是在VMD里的

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